NR1I2

NR1I2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1ILG, 1ILH, 1M13, 1NRL, 1SKX, 2O9I, 2QNV, 3CTB, 3HVL, 3R8D, 4J5W, 4J5X, 4NY9, 4S0S, 4S0T, 4XHD, 4X1F, 4X1G, 4XAO, 5A86
Ідентифікатори
Символи	NR1I2, BXR, ONR1, PAR, PAR1, PAR2, PARq, PRR, PXR, SAR, SXR, nuclear receptor subfamily 1 group I member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603065 MGI: 1337040 HomoloGene: 40757 GeneCards: NR1I2
Реагує на сполуку
	Естрадіол, 5β-pregnane-3,20-dione, клотримазол, lithocholic acid, міфепристон, ніфедипін, паклітаксел, фенобарбітал, ловастатин
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • steroid hormone receptor activity; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • transcription factor binding; • nuclear receptor coactivator activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • ядерні тільця; • intermediate filament cytoskeleton; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• steroid metabolic process; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • xenobiotic transport; • xenobiotic export; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • xenobiotic metabolic process; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • steroid hormone mediated signaling pathway; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • intracellular receptor signaling pathway; • multicellular organism development; • диференціація клітин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	8856
	18171
	ENSG00000144852
	ENSMUSG00000022809
	O75469
	O54915
	NM_033013; NM_003889; NM_022002
	NM_001098404; NM_010936
	NP_003880; NP_071285; NP_148934
	NP_001091874; NP_035066
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NR1I2 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 434 амінокислот, а молекулярна маса — 49 762^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEVRPKESWN	HADFVHCEDT	ESVPGKPSVN	ADEEVGGPQI	CRVCGDKATG
YHFNVMTCEG	CKGFFRRAMK	RNARLRCPFR	KGACEITRKT	RRQCQACRLR
KCLESGMKKE	MIMSDEAVEE	RRALIKRKKS	ERTGTQPLGV	QGLTEEQRMM
IRELMDAQMK	TFDTTFSHFK	NFRLPGVLSS	GCELPESLQA	PSREEAAKWS
QVRKDLCSLK	VSLQLRGEDG	SVWNYKPPAD	SGGKEIFSLL	PHMADMSTYM
FKGIISFAKV	ISYFRDLPIE	DQISLLKGAA	FELCQLRFNT	VFNAETGTWE
CGRLSYCLED	TAGGFQQLLL	EPMLKFHYML	KKLQLHEEEY	VLMQAISLFS
PDRPGVLQHR	VVDQLQEQFA	ITLKSYIECN	RPQPAHRFLF	LKIMAMLTEL
RSINAQHTQR	LLRIQDIHPF	ATPLMQELFG	ITGS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Geick A., Eichelbaum M., Burk O. (2001). Nuclear receptor response elements mediate induction of intestinal MDR1 by rifampin. J. Biol. Chem. 276: 14581—14587. PMID 11297522 DOI:10.1074/jbc.M010173200
Li Y., Ross-Viola J.S., Shay N.F., Moore D.D., Ricketts M.L. (2009). Human CYP3A4 and murine Cyp3A11 are regulated by equol and genistein via the pregnane X receptor in a species-specific manner. J. Nutr. 139: 898—904. PMID 19297428 DOI:10.3945/jn.108.103572
Watkins R.E., Davis-Searles P.R., Lambert M.H., Redinbo M.R. (2003). Coactivator binding promotes the specific interaction between ligand and the pregnane X receptor. J. Mol. Biol. 331: 815—828. PMID 12909012 DOI:10.1016/S0022-2836(03)00795-2
Teotico D.G., Bischof J.J., Peng L., Kliewer S.A., Redinbo M.R. (2008). Structural basis of human pregnane X receptor activation by the hops constituent colupulone. Mol. Pharmacol. 74: 1512—1520. PMID 18768384 DOI:10.1124/mol.108.050732