CRAT

CRAT (англ. Carnitine O-acetyltransferase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 626 амінокислот, а молекулярна маса — 70 858.

CRAT
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1NM8, 1S5O
Ідентифікатори
Символи	CRAT, carnitine O-acetyltransferase, CAT1, CAT, NBIA8
Зовнішні ІД	OMIM: 600184 MGI: 109501 HomoloGene: 598 GeneCards: CRAT
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • acyltransferase activity • signaling receptor binding • carnitine O-acetyltransferase activity Клітинна компонента • мітохондріальна внутрішня мембрана • пероксисома • peroxisomal matrix • ендоплазматичний ретикулум • мембрана • мітохондрія • гіалоплазма Біологічний процес • fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA oxidase • fatty acid metabolic process • lipid metabolism • carnitine metabolic process, CoA-linked • GO:0015915 транспорт • protein targeting to peroxisome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1384	12908
Ensembl	ENSG00000095321	ENSMUSG00000026853
UniProt	P43155	P47934
RefSeq (мРНК)	NM_000755 NM_001257363 NM_004003 NM_144782 NM_001346546 NM_001346547 NM_001346548 NM_001346549	NM_007760
RefSeq (білок)	NP_000746 NP_001244292 NP_001333475 NP_001333476 NP_001333477 NP_001333478 NP_003994	NP_031786
Локус (UCSC)	Хр. 9: 129.09 – 129.11 Mb	Хр. 2: 30.4 – 30.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLAFAARTVV		KPLGFLKPFS		LMKASSRFKA		HQDALPRLPV		PPLQQSLDHY
LKALQPIVSE		EEWAHTKQLV		DEFQASGGVG		ERLQKGLERR		ARKTENWLSE
WWLKTAYLQY		RQPVVIYSSP		GVMLPKQDFV		DLQGQLRFAA		KLIEGVLDFK
VMIDNETLPV		EYLGGKPLCM		NQYYQILSSC		RVPGPKQDTV		SNFSKTKKPP
THITVVHNYQ		FFELDVYHSD		GTPLTADQIF		VQLEKIWNSS		LQTNKEPVGI
LTSNHRNSWA		KAYNTLIKDK		VNRDSVRSIQ		KSIFTVCLDA		TMPRVSEDVY
RSHVAGQMLH		GGGSRLNSGN		RWFDKTLQFI		VAEDGSCGLV		YEHAAAEGPP
IVTLLDYVIE		YTKKPELVRS		PLVPLPMPKK		LRFNITPEIK		SDIEKAKQNL
SIMIQDLDIT		VMVFHHFGKD		FPKSEKLSPD		AFIQMALQLA		YYRIYGQACA
TYESASLRMF		HLGRTDTIRS		ASMDSLTFVK		AMDDSSVTEH		QKVELLRKAV
QAHRGYTDRA		IRGEAFDRHL		LGLKLQAIED		LVSMPDIFMD		TSYAIAMHFH
LSTSQVPAKT		DCVMFFGPVV		PDGYGVCYNP		MEAHINFSLS		AYNSCAETNA
ARLAHYLEKA		LLDMRALLQS		HPRAKL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, ацилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм жирних кислот, метаболізм ліпідів, транспорт, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі, пероксисомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Corti O., DiDonato S., Finocchiaro G. (1994). Divergent sequences in the 5' region of cDNA suggest alternative splicing as a mechanism for the generation of carnitine acetyltransferases with different subcellular localizations. Biochem. J. 303: 37—41. PMID 7945262 DOI:10.1042/bj3030037
• Corti O., Finocchiaro G., Rossi E., Zuffardi O., Didonato S. (1994). Molecular cloning of cDNAs encoding human carnitine acetyltransferase and mapping of the corresponding gene to chromosome 9q34.1. Genomics. 23: 94—99. PMID 7829107 DOI:10.1006/geno.1994.1463

Див. також

• Хромосома 9