Вікіпедія

Метаболоміка

(Перенаправлено з Метаболома)

Метаболоміка — наукова дисципліна, яка зосереджена на комплексному аналізі та кількісному визначенні масиву різноманітних малих молекул (метаболітів) у біологічній системі, який в сукупності називають метаболом. Метаболоміка охоплює систематичне вивчення цих метаболітів, які є ключовими індикаторами клітинних процесів і фізіологічного стану.

Схематичний опис робочого процесу метаболомічного аналізу.[1]

Метаболоміка використовує передові аналітичні технології, такі як мас-спектрометрія, РХ-МС, ЯМР-спектроскопія та спектрометрія рухливості іонів[en], щоб ідентифікувати, виміряти та охарактеризувати повний набір метаболітів, присутніх у клітинах, тканинах, біорідинах або організмах. Цей цілісний підхід забезпечує миттєвий знімок динамічного метаболічного профілю під впливом генетичних, екологічних і фізіологічних факторів.

Вловлюючи складну взаємодію між генами, білками та стимулами навколишнього середовища, метаболоміка пропонує глибоке розуміння метаболічних шляхів[en], допомагаючи в розумінні механізмів захворювання, реакції на ліки та відкриття біомаркерів[en]. Застосування метаболоміки охоплює різні сфери, включаючи медицину й біомедицину, біотехнологію, ботаніку й рослинництво, агрономію й сільське господарство, нутриціологію, екологію, науку про навколишнє середовище, а також стимулювання інновацій у персоналізованій медицині, точному землеробстві та дослідження біохімічних процесів у різноманітних екосистемах.

Міждисциплінарний характер метаболоміки об’єднує біохімію й аналітичну хімію, біологію, біомедицину, біоінформатику та обчислювальне моделювання, статистику та системну біологію, полегшуючи інтерпретацію та інтеграцію величезних наборів даних для розкриття складних біологічних явищ.

Походження слова ред.

 
Основні історичні віхи й відкриття в метаболоміці та інших оміксних технологіях.[2]

Термін метаболоміка був утворений шляхом додавання суфіксу -omik за аналогією з іншими оміксними технологіями, такими як геноміка, епігеноміка, протеоміка, метагеноміка та ін. Слово походить від метаболізму (= обмін речовин).

Іноді використовується позначення метабоном (через н), особливо в контексті оцінки токсичності активних речовин. У фахових колах активно дискутують щодо точних відмінностей між метаболомом і метабономом.[джерело?]

Методи і показники ред.

Цей розділ потребує доповнення.
 
Схема робочого процесу в метаболомічному аналізі.[3]

Методи метаболоміки можна розділити на методи розділення, методи іонізації та методи виявлення. Оскільки метаболіти можуть сильно відрізнятися за хімічним складом і структурою, часто недостатньо використовувати лише один метод аналізу, щоб повністю розібрати метаболом окремого організму. Крім того, ще й досі невідомо, скільки всього продуктів метаболізму існує. Найпоширенішими типами таких продуктів є біологічні рідини організму, такі як плазма або сироватка крові, а також сеча, спинномозкова рідина, синовіальна рідина, мокротиння або лаваж. Поряд із попередніми розглядаються також гомогенати тканин або клітини або супернатанти клітинних культур.

До показників в метаболоміці належать:

Іншими аспектами метаболоміки є вплив від надходження поживних речовин, вплив активних речовин на метаболізм і різні функції клітин, як-от проліферація, диференціювання та апоптоз.

Метаболом ред.

Метаболом являє собою повний набір малих молекул, відомих як метаболіти, у біологічній системі, будь то клітина, тканина, орган чи організм. Ці метаболіти є кінцевими продуктами клітинних процесів і відіграють вирішальну роль у біохімічних реакціях і сигнальних шляхах, які підтримують життя.

Метаболом містить різноманітний набір сполук, включаючи амінокислоти, ліпіди (див. також Ліпідоміка[en]), вуглеводи (див. також Глікоміка[en]), гормони та органічні кислоти, що дає динамічний знімок метаболічного статусу біологічної системи в певний момент. Цей складний і постійно мінливий молекулярний ландшафт відображає взаємодію між генами організму, його середовищем і різними внутрішніми фізіологічними факторами. Дослідження метаболома дозволяють ідентифікувати, кількісно визначити та профілювати тисячі метаболітів, присутніх у біологічних зразках.

Розуміння метаболома має важливе значення для розшифровки функціональних характеристик біологічних систем, оскільки воно дає уявлення про метаболічні шляхи, клітинні реакції на подразники та механізми, що лежать в основі взаємодії здоров’я, хвороб і навколишнього середовища. Шляхом картографування та інтерпретації метаболома дослідники можуть виявити біомаркери, що вказують на хвороби, передбачити реакцію на ліки, виявити метаболічні порушення та дослідити заплутану мережу біохімічних реакцій, що відбуваються в живих організмах. Метаболом, як комплексне відображення біохімічних процесів у живих системах, продовжує залишатися центром наукових досліджень, надаючи величезні надії на вдосконалення нашого розуміння біології, здоров’я та навколишнього середовища. Його постійне вивчення та з’ясування значною мірою сприяють розвитку інноваційних підходів у різних дисциплінах, сприяючи прогресу в напрямку покращення здоров’я людини та стійких екосистем.

Перспективні технології ред.

Метаболоміка, галузь наук про життя, що активно розвивається, спирається на передові технології, щоб розкрити складний ландшафт метаболітів у біологічних системах. Удосконалення аналітичних методологій зробили революцію у вивченні метаболоміки, запропонувавши безпрецедентне розуміння клітинних процесів, механізмів захворювання та взаємодії навколишнього середовища.[4]

Досягнення мас-спектрометрії ред.

Мас-спектрометрія (МС) є наріжним каменем метаболоміки, постійно розвиваючись, щоб підвищити чутливість, роздільну здатність і охоплення виявлення метаболітів. Останні досягнення в технологіях МС, включаючи мас-аналізатори високої роздільної здатності (HRMS)[5][6], нові методи іонізації[7][8][9] та стратегії збору даних[10][11][12][13], розширили можливості метаболоміки.

Такі методи, як візуалізація мас-спектрометрії[en], дозволяють просторово відображати метаболіти в тканинах, відкриваючи просторово розділені метаболічні сигнатури, важливі для розуміння локалізованої метаболічної активності.[14][15][16][17]

Інновації в спектроскопії ядерного магнітного резонансу ред.

ЯМР-спектроскопія, яку шанують за її неруйнівну природу та кількісні можливості, зазнала трансформаційного розвитку.[18][19][20][21] Прилади ЯМР із надсильним полем (Ultra-high field NMR)[22] у поєднанні з передовими імпульсними послідовностями[23] та методами ізотопного маркування[en][24] дозволяють ідентифікувати та кількісно визначити метаболіти з неперевершеною точністю.[25] Інновації в методах динамічної ядерної поляризації[en] (DNP) пропонують підвищену чутливість, розкриваючи потенціал для вивчення низьких метаболітів у складних біологічних матрицях.[26][27][28]

Техніки з дефісом і багатовимірний аналіз ред.

Інтеграція хроматографії з мас-спектрометрією або ЯМР-спектроскопією в "дефісних" методах[29] дозволяє покращити розділення та характеристику метаболітів. Платформи рідинної хроматографії-мас-спектрометрії (РХ-МС) і газової хроматографія-мас-спектрометрії[en] (ГХ-МС) у поєднанні з вдосконаленими методами розділення[30] та багатовимірним аналізом дають можливість комплексного профілювання метаболітів.[31][32][33] Ці багатовимірні підходи покращують охоплення метаболітів і допомагають у ідентифікації невловимих або лабільних метаболітів.

БІоінформатика та обчислювальні інструменти ред.

Потік метаболомічних даних вимагає складних обчислювальних інструментів і підходів біоінформатики для обробки, аналізу та інтерпретації даних. Алгоритми машинного навчання[34][35][36][37], мережеве моделювання[38][39][40] та аналіз метаболічних шляхів[en][41][42] дозволяють отримувати значущу інформацію зі складних наборів даних.

Мультиоміка ред.

Мультиоміка забезпечує інтеграцію різноманітних даних оміксних технологій — таких як геноміка (геном), епігеноміка (епігеном), протеоміка (протеом), транскриптоміка (транскриптом), метаболоміка (метаболом) та ін. — що ще більше покращує наше розуміння складних зв’язків між молекулярними компонентами в біологічних системах.[43][44]

Нові технології та майбутні напрямки ред.

Крім усталених методологій, новітні технології, такі як одноклітинна[en] метаболоміка[45][46][47][48], аналіз на основі мікрофлюїдики[en][49] та нові біосенсори[50][51][52][53], є перспективними для дослідження клітинної гетерогенності та метаболічної динаміки в реальному часі. Крім того, досягнення в ідентифікації метаболітів за допомогою спектральних бібліотек[54], стандартизації та процедур контролю якості спрямовані на підвищення відтворюваності та надійності даних, сприяючи співпраці та обміну даними між дослідниками.

Див. також ред.

Додаткова література ред.

Книги ред.

Журнали ред.

Статті ред.

Зовнішні посилання ред.

Примітки ред.

  1. ↑ Al-Sulaiti, Haya; Almaliti, Jehad; Naman, C. Benjamin; Al Thani, Asmaa A.; Yassine, Hadi M. (2023-08). Metabolomics Approaches for the Diagnosis, Treatment, and Better Disease Management of Viral Infections. Metabolites (англ.). Т. 13, № 8. с. 948. doi:10.3390/metabo13080948. ISSN 2218-1989. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  2. ↑ Babu, Mohan; Snyder, Michael (2023-06). Multi-Omics Profiling for Health. Molecular & Cellular Proteomics. Т. 22, № 6. с. 100561. doi:10.1016/j.mcpro.2023.100561. ISSN 1535-9476. PMC 10220275. PMID 37119971. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  3. ↑ Du, Xiaohui; Yang, Le; Kong, Ling; Sun, Ye; Shen, Kunshuang; Cai, Ying; Sun, Hui; Zhang, Bo; Guo, Sifan (2022). Metabolomics of various samples advancing biomarker discovery and pathogenesis elucidation for diabetic retinopathy. Frontiers in Endocrinology. Т. 13. doi:10.3389/fendo.2022.1037164/full. ISSN 1664-2392. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  4. ↑ Miggiels, Paul; Wouters, Bert; van Westen, Gerard J. P.; Dubbelman, Anne-Charlotte; Hankemeier, Thomas (1 листопада 2019). Novel technologies for metabolomics: More for less. TrAC Trends in Analytical Chemistry. Т. 120. с. 115323. doi:10.1016/j.trac.2018.11.021. ISSN 0165-9936. Процитовано 20 грудня 2023.
  5. ↑ Zarrouk, Eliès; Lenski, Marie; Bruno, Clément; Thibert, Valérie; Contreras, Paul; Privat, Kevin; Ameline, Alice; Fabresse, Nicolas (1 січня 2022). High-resolution mass spectrometry: Theoretical and technological aspects. Toxicologie Analytique et Clinique. Т. 34, № 1, Supplement. с. 3—18. doi:10.1016/j.toxac.2021.11.002. ISSN 2352-0078. Процитовано 20 грудня 2023.
  6. ↑ Hu, Ximin; Mar, Derek; Suzuki, Nozomi; Zhang, Bowei; Peter, Katherine T.; Beck, David A. C.; Kolodziej, Edward P. (23 вересня 2023). Mass-Suite: a novel open-source python package for high-resolution mass spectrometry data analysis. Journal of Cheminformatics (англ.). Т. 15, № 1. doi:10.1186/s13321-023-00741-9. ISSN 1758-2946. PMC 10517472. PMID 37741995. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  7. ↑ Feuerstein, Max L.; Kurulugama, Ruwan T.; Hann, Stephan; Causon, Tim (8 червня 2021). Novel acquisition strategies for metabolomics using drift tube ion mobility-quadrupole resolved all ions time-of-flight mass spectrometry (IM-QRAI-TOFMS). Analytica Chimica Acta. Т. 1163. с. 338508. doi:10.1016/j.aca.2021.338508. ISSN 0003-2670. Процитовано 20 грудня 2023.
  8. ↑ Challen, Bob; Cramer, Rainer (2022-08). Advances in ionisation techniques for mass spectrometry‐based omics research. PROTEOMICS (англ.). Т. 22, № 15-16. doi:10.1002/pmic.202100394. ISSN 1615-9853. Процитовано 20 грудня 2023.
  9. ↑ Zeng, Qingli; Xia, Meng-Chan; Yin, Xinchi; Cheng, Simin; Xue, Zhichao; Tan, Siyuan; Gong, Xiaoyun; Ye, Zihong (2023). Recent developments in ionization techniques for single-cell mass spectrometry. Frontiers in Chemistry. Т. 11. doi:10.3389/fchem.2023.1293533. ISSN 2296-2646. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  10. ↑ Mullard, Graham; Allwood, James W.; Weber, Ralf; Brown, Marie; Begley, Paul; Hollywood, Katherine A.; Jones, Martin; Unwin, Richard D.; Bishop, Paul N. (2015-10). A new strategy for MS/MS data acquisition applying multiple data dependent experiments on Orbitrap mass spectrometers in non-targeted metabolomic applications. Metabolomics (англ.). Т. 11, № 5. с. 1068—1080. doi:10.1007/s11306-014-0763-6. ISSN 1573-3882. Процитовано 20 грудня 2023.
  11. ↑ Davies, Vinny; Wandy, Joe; Weidt, Stefan; van der Hooft, Justin J. J.; Miller, Alice; Daly, Rónán; Rogers, Simon (13 квітня 2021). Rapid Development of Improved Data-Dependent Acquisition Strategies. Analytical Chemistry (англ.). Т. 93, № 14. с. 5676—5683. doi:10.1021/acs.analchem.0c03895. ISSN 0003-2700. PMC 8047769. PMID 33784814. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  12. ↑ Defossez, Emmanuel; Bourquin, Julien; von Reuss, Stephan; Rasmann, Sergio; Glauser, Gaétan (2023-01). Eight key rules for successful data‐dependent acquisition in mass spectrometry‐based metabolomics. Mass Spectrometry Reviews (англ.). Т. 42, № 1. с. 131—143. doi:10.1002/mas.21715. ISSN 0277-7037. PMC 10078780. PMID 34145627. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  13. ↑ Wandy, Joe; McBride, Ross; Rogers, Simon; Terzis, Nikolaos; Weidt, Stefan; van der Hooft, Justin J. J.; Bryson, Kevin; Daly, Rónán; Davies, Vinny (2023). Simulated-to-real benchmarking of acquisition methods in untargeted metabolomics. Frontiers in Molecular Biosciences. Т. 10. doi:10.3389/fmolb.2023.1130781. ISSN 2296-889X. PMC 10027714. PMID 36959982. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  14. ↑ Boughton, Berin A.; Thinagaran, Dinaiz; Sarabia, Daniel; Bacic, Antony; Roessner, Ute (1 червня 2016). Mass spectrometry imaging for plant biology: a review. Phytochemistry Reviews (англ.). Т. 15, № 3. с. 445—488. doi:10.1007/s11101-015-9440-2. ISSN 1572-980X. PMC 4870303. PMID 27340381. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  15. ↑ Granborg, Jonatan Riber; Handler, Anne Mette; Janfelt, Christian (1 січня 2022). Mass spectrometry imaging in drug distribution and drug metabolism studies – Principles, applications and perspectives. TrAC Trends in Analytical Chemistry. Т. 146. с. 116482. doi:10.1016/j.trac.2021.116482. ISSN 0165-9936. Процитовано 20 грудня 2023.
  16. ↑ Lamont, Lieke; Hadavi, Darya; Viehmann, Brent; Flinders, Bryn; Heeren, Ron M. A.; Vreeken, Rob J.; Porta Siegel, Tiffany (2021-04). Quantitative mass spectrometry imaging of drugs and metabolites: a multiplatform comparison. Analytical and Bioanalytical Chemistry (англ.). Т. 413, № 10. с. 2779—2791. doi:10.1007/s00216-021-03210-0. ISSN 1618-2642. PMC 8007509. PMID 33770207. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  17. ↑ Song, Xiaowei; Li, Chao; Meng, Yifan (23 грудня 2022). Mass spectrometry imaging advances and application in pharmaceutical research. Acta Materia Medica (англ.). Т. 1, № 4. doi:10.15212/AMM-2022-0046. ISSN 2737-7946. Процитовано 20 грудня 2023.
  18. ↑ Emwas, Abdul-Hamid; Roy, Raja; McKay, Ryan T.; Tenori, Leonardo; Saccenti, Edoardo; Gowda, G. A. Nagana; Raftery, Daniel; Alahmari, Fatimah; Jaremko, Lukasz (2019-07). NMR Spectroscopy for Metabolomics Research. Metabolites (англ.). Т. 9, № 7. с. 123. doi:10.3390/metabo9070123. ISSN 2218-1989. PMC 6680826. PMID 31252628. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  19. ↑ Huang, Katherine; Thomas, Natalie; Gooley, Paul R.; Armstrong, Christopher W. (2022-10). Systematic Review of NMR-Based Metabolomics Practices in Human Disease Research. Metabolites (англ.). Т. 12, № 10. с. 963. doi:10.3390/metabo12100963. ISSN 2218-1989. PMC 9609461. PMID 36295865. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  20. ↑ Wishart, David S.; Cheng, Leo L.; Copié, Valérie; Edison, Arthur S.; Eghbalnia, Hamid R.; Hoch, Jeffrey C.; Gouveia, Goncalo J.; Pathmasiri, Wimal; Powers, Robert (2022-08). NMR and Metabolomics—A Roadmap for the Future. Metabolites (англ.). Т. 12, № 8. с. 678. doi:10.3390/metabo12080678. ISSN 2218-1989. PMC 9394421. PMID 35893244. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  21. ↑ Mulder, Frans A. A.; Tenori, Leonardo; Licari, Cristina; Luchinat, Claudio (1 липня 2023). Practical considerations for rapid and quantitative NMR-based metabolomics. Journal of Magnetic Resonance. Т. 352. с. 107462. doi:10.1016/j.jmr.2023.107462. ISSN 1090-7807. Процитовано 20 грудня 2023.
  22. ↑ Moser, Ewald; Laistler, Elmar; Schmitt, Franz; Kontaxis, Georg (2017). Ultra-High Field NMR and MRI—The Role of Magnet Technology to Increase Sensitivity and Specificity. Frontiers in Physics. Т. 5. doi:10.3389/fphy.2017.00033. ISSN 2296-424X. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  23. ↑ Singh, Upendra; Alsuhaymi, Shuruq; Al-Nemi, Ruba; Emwas, Abdul-Hamid; Jaremko, Mariusz (4 липня 2023). Compound-Specific 1D 1 H NMR Pulse Sequence Selection for Metabolomics Analyses. ACS Omega (англ.). Т. 8, № 26. с. 23651—23663. doi:10.1021/acsomega.3c01688. ISSN 2470-1343. PMC 10324067. PMID 37426221. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  24. ↑ Gowda, G. A. Nagana; Shanaiah, Narasimhamurthy; Raftery, Daniel (2012). Atreya, Hanudatta S. (ред.). Isotope Enhanced Approaches in Metabolomics. Isotope labeling in Biomolecular NMR (англ.). Dordrecht: Springer Netherlands. с. 147—164. doi:10.1007/978-94-007-4954-2_8. ISBN 978-94-007-4954-2. PMC 4754079. PMID 23076583.{{cite book}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  25. ↑ Chen, Xi; Bertho, Gildas; Caradeuc, Cédric; Giraud, Nicolas; Lucas‐Torres, Covadonga (2023-12). Present and future of pure shift NMR in metabolomics. Magnetic Resonance in Chemistry (англ.). Т. 61, № 12. с. 654—673. doi:10.1002/mrc.5356. ISSN 0749-1581. Процитовано 20 грудня 2023.
  26. ↑ Lerche, Mathilde H.; Karlsson, Magnus; Ardenkjær-Larsen, Jan H.; Jensen, Pernille R. (2019). Gowda, G. A. Nagana; Raftery, Daniel (ред.). Targeted Metabolomics with Quantitative Dissolution Dynamic Nuclear Polarization. NMR-Based Metabolomics: Methods and Protocols (англ.). New York, NY: Springer. с. 385—393. doi:10.1007/978-1-4939-9690-2_21. ISBN 978-1-4939-9690-2.
  27. ↑ Dey, Arnab; Charrier, Benoît; Lemaitre, Karine; Ribay, Victor; Eshchenko, Dmitry; Schnell, Marc; Melzi, Roberto; Stern, Quentin; Cousin, Samuel F. (29 вересня 2022). Fine optimization of a dissolution dynamic nuclear polarization experimental setting for 13 C NMR of metabolic samples. Magnetic Resonance (англ.). Т. 3, № 2. с. 183—202. doi:10.5194/mr-3-183-2022. ISSN 2699-0016. PMC 10583282. PMID 37904870. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  28. ↑ Ribay, Victor; Praud, Clément; Letertre, Marine P. M.; Dumez, Jean-Nicolas; Giraudeau, Patrick (1 червня 2023). Hyperpolarized NMR metabolomics. Current Opinion in Chemical Biology. Т. 74. с. 102307. doi:10.1016/j.cbpa.2023.102307. ISSN 1367-5931. Процитовано 20 грудня 2023.
  29. ↑ Patel, Kalpesh N.; Patel, Jayvadan K.; Patel, Manish P.; Rajput, Ganesh C.; Patel, Hitesh A. (11 жовтня 2010). Introduction to hyphenated techniques and their applications in pharmacy (RETRACTED). Pharmaceutical Methods. Т. 1, № 1. с. 89—89. doi:10.4103/2229-4708.72222. ISSN 2229-4716. PMC 3658024. PMID 23781411. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  30. ↑ Advances in Separation Methods for Metabolomics and Lipidomics. www.mdpi.com (англ.). Процитовано 20 грудня 2023.
  31. ↑ Yuan, Fang; Kim, Seongho; Yin, Xinmin; Zhang, Xiang; Kato, Ikuko (2020-09). Integrating Two-Dimensional Gas and Liquid Chromatography-Mass Spectrometry for Untargeted Colorectal Cancer Metabolomics: A Proof-of-Principle Study. Metabolites (англ.). Т. 10, № 9. с. 343. doi:10.3390/metabo10090343. ISSN 2218-1989. PMC 7569982. PMID 32854360. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  32. ↑ Amin, Ruhul; Alam, Faruk; Dey, Biplab Kumar; Mandhadi, Jithendar Reddy; Bin Emran, Talha; Khandaker, Mayeen Uddin; Safi, Sher Zaman (2022-11). Multidimensional Chromatography and Its Applications in Food Products, Biological Samples and Toxin Products: A Comprehensive Review. Separations (англ.). Т. 9, № 11. с. 326. doi:10.3390/separations9110326. ISSN 2297-8739. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  33. ↑ Cai, Yuping; Zhou, Zhiwei; Zhu, Zheng-Jiang (1 січня 2023). Advanced analytical and informatic strategies for metabolite annotation in untargeted metabolomics. TrAC Trends in Analytical Chemistry. Т. 158. с. 116903. doi:10.1016/j.trac.2022.116903. ISSN 0165-9936. Процитовано 20 грудня 2023.
  34. ↑ Galal, Aya; Talal, Marwa; Moustafa, Ahmed (2022). Applications of machine learning in metabolomics: Disease modeling and classification. Frontiers in Genetics. Т. 13. doi:10.3389/fgene.2022.1017340. ISSN 1664-8021. PMC 9730048. PMID 36506316. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  35. ↑ Martinelli, Dominic D. (1 січня 2023). Machine learning for metabolomics research in drug discovery. Intelligence-Based Medicine. Т. 8. с. 100101. doi:10.1016/j.ibmed.2023.100101. ISSN 2666-5212. Процитовано 20 грудня 2023.
  36. ↑ Zhang, J. Diana; Xue, Chonghua; Kolachalama, Vijaya B.; Donald, William A. (24 травня 2023). Interpretable Machine Learning on Metabolomics Data Reveals Biomarkers for Parkinson’s Disease. ACS Central Science (англ.). Т. 9, № 5. с. 1035—1045. doi:10.1021/acscentsci.2c01468. ISSN 2374-7943. PMC 10214508. PMID 37252351. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  37. ↑ Peng, Yifei; Zheng, Chao; Guo, Shuang; Gao, Fuquan; Wang, Xiaxia; Du, Zhenghua; Gao, Feng; Su, Feng; Zhang, Wenjing (16 березня 2023). Metabolomics integrated with machine learning to discriminate the geographic origin of Rougui Wuyi rock tea. npj Science of Food (англ.). Т. 7, № 1. с. 7. doi:10.1038/s41538-023-00187-1. ISSN 2396-8370. Процитовано 20 грудня 2023.
  38. ↑ Perez De Souza, Leonardo; Alseekh, Saleh; Brotman, Yariv; Fernie, Alisdair R (2 квітня 2020). Network-based strategies in metabolomics data analysis and interpretation: from molecular networking to biological interpretation. Expert Review of Proteomics (англ.). Т. 17, № 4. с. 243—255. doi:10.1080/14789450.2020.1766975. ISSN 1478-9450. Процитовано 20 грудня 2023.
  39. ↑ Amara, Adam; Frainay, Clément; Jourdan, Fabien; Naake, Thomas; Neumann, Steffen; Novoa-del-Toro, Elva María; Salek, Reza M; Salzer, Liesa; Scharfenberg, Sarah (2022). Networks and Graphs Discovery in Metabolomics Data Analysis and Interpretation. Frontiers in Molecular Biosciences. Т. 9. doi:10.3389/fmolb.2022.841373. ISSN 2296-889X. PMC 8957799. PMID 35350714. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  40. ↑ Noecker, Cecilia; Eng, Alexander; Muller, Efrat; Borenstein, Elhanan (6 січня 2022). MIMOSA2: a metabolic network-based tool for inferring mechanism-supported relationships in microbiome-metabolome data. Bioinformatics. Т. 38, № 6. с. 1615—1623. doi:10.1093/bioinformatics/btac003. ISSN 1367-4803. PMC 8896604. PMID 34999748. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  41. ↑ Wieder, Cecilia; Lai, Rachel P. J.; Ebbels, Timothy M. D. (14 листопада 2022). Single sample pathway analysis in metabolomics: performance evaluation and application. BMC Bioinformatics (англ.). Т. 23, № 1. doi:10.1186/s12859-022-05005-1. ISSN 1471-2105. PMC 9664704. PMID 36376837. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  42. ↑ Tsouka, Sofia; Masoodi, Mojgan (2023-02). Metabolic Pathway Analysis: Advantages and Pitfalls for the Functional Interpretation of Metabolomics and Lipidomics Data. Biomolecules (англ.). Т. 13, № 2. с. 244. doi:10.3390/biom13020244. ISSN 2218-273X. PMC 9953275. PMID 36830612. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  43. ↑ Jendoubi, Takoua (2021-03). Approaches to Integrating Metabolomics and Multi-Omics Data: A Primer. Metabolites (англ.). Т. 11, № 3. с. 184. doi:10.3390/metabo11030184. ISSN 2218-1989. PMC 8003953. PMID 33801081. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  44. ↑ Maan, Kiran; Baghel, Ruchi; Dhariwal, Seema; Sharma, Apoorva; Bakhshi, Radhika; Rana, Poonam (9 вересня 2023). Metabolomics and transcriptomics based multi-omics integration reveals radiation-induced altered pathway networking and underlying mechanism. npj Systems Biology and Applications (англ.). Т. 9, № 1. с. 1—13. doi:10.1038/s41540-023-00305-5. ISSN 2056-7189. Процитовано 20 грудня 2023.
  45. ↑ Seydel, Caroline (2021-12). Single-cell metabolomics hits its stride. Nature Methods (англ.). Т. 18, № 12. с. 1452—1456. doi:10.1038/s41592-021-01333-x. ISSN 1548-7105. Процитовано 20 грудня 2023.
  46. ↑ Lanekoff, Ingela; Sharma, Varun V; Marques, Cátia (1 червня 2022). Single-cell metabolomics: where are we and where are we going?. Current Opinion in Biotechnology. Т. 75. с. 102693. doi:10.1016/j.copbio.2022.102693. ISSN 0958-1669. Процитовано 20 грудня 2023.
  47. ↑ Ali, Ahmed; Davidson, Shawn; Fraenkel, Ernest; Gilmore, Ian; Hankemeier, Thomas; Kirwan, Jennifer A.; Lane, Andrew N.; Lanekoff, Ingela; Larion, Mioara (1 жовтня 2022). Single cell metabolism: current and future trends. Metabolomics (англ.). Т. 18, № 10. с. 77. doi:10.1007/s11306-022-01934-3. ISSN 1573-3890. PMC 10063251. PMID 36181583. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  48. ↑ Pandian, Kanchana; Matsui, Minami; Hankemeier, Thomas; Ali, Ahmed; Okubo-Kurihara, Emiko (20 червня 2023). Advances in single-cell metabolomics to unravel cellular heterogeneity in plant biology. Plant Physiology. Т. 193, № 2. с. 949—965. doi:10.1093/plphys/kiad357. ISSN 0032-0889. PMC 10517197. PMID 37338502. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  49. ↑ Wang, Chenlong; Hu, Wanting; Guan, Liandi; Yang, Xiaoping; Liang, Qionglin (1 червня 2022). Single-cell metabolite analysis on a microfluidic chip. Chinese Chemical Letters. Т. 33, № 6. с. 2883—2892. doi:10.1016/j.cclet.2021.10.006. ISSN 1001-8417. Процитовано 20 грудня 2023.
  50. ↑ Chen, Xingxiu; Yang, Zhibo (1 січня 2022). Chen, Jian; Lu, Yao (ред.). Chapter 3 - Biosensors for single-cell metabolomic characterization. Biosensors for Single-Cell Analysis. Academic Press. с. 37—70. doi:10.1016/b978-0-323-89841-6.00001-3. ISBN 978-0-323-89841-6.
  51. ↑ Eissa, Shimaa (2023). Abdel Rahman, Anas M. (ред.). Transferring Metabolomics to Portable Diagnostic Devices: Trending in Biosensors. Clinical Metabolomics Applications in Genetic Diseases (англ.). Singapore: Springer Nature Singapore. с. 327—350. doi:10.1007/978-981-99-5162-8_15. ISBN 978-981-99-5161-1.
  52. ↑ Nastase, Ana-Maria (2021). Metabolomics and biosensor approaches to the detection of fever associated diseases (PDF).
  53. ↑ Wang, Minqiang; Yang, Yiran; Min, Jihong; Song, Yu; Tu, Jiaobing; Mukasa, Daniel; Ye, Cui; Xu, Changhao; Heflin, Nicole (2022-11). A wearable electrochemical biosensor for the monitoring of metabolites and nutrients. Nature Biomedical Engineering (англ.). Т. 6, № 11. с. 1225—1235. doi:10.1038/s41551-022-00916-z. ISSN 2157-846X. Процитовано 20 грудня 2023.
  54. ↑ Bittremieux, Wout; Wang, Mingxun; Dorrestein, Pieter C. (19 листопада 2022). The critical role that spectral libraries play in capturing the metabolomics community knowledge. Metabolomics (англ.). Т. 18, № 12. doi:10.1007/s11306-022-01947-y. ISSN 1573-3890. PMC 10284100. PMID 36409434. Процитовано 20 грудня 2023.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
Отримано з https://uk.wikipedia.org/w/index.php?title=Метаболоміка&oldid=41184273