ZSCAN4

ZSCAN4 (англ. Zinc finger and SCAN domain containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 433 амінокислот, а молекулярна маса — 48 957.

ZSCAN4
Ідентифікатори
Символи	ZSCAN4, ZNF494, zinc finger and SCAN domain containing 4
Зовнішні ІД	OMIM: 613419 MGI: 3708485 HomoloGene: 138332 GeneCards: ZSCAN4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • теломера • хромосома • клітинне ядро Біологічний процес • telomere maintenance via telomere lengthening • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of mitotic recombination • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	201516	665902
Ensembl	ENSG00000180532	ENSMUSG00000070828
UniProt	Q8NAM6	Q3URS2
RefSeq (мРНК)	NM_152677 NM_001384833	NM_001110316
RefSeq (білок)	NP_689890	NP_001103786
Локус (UCSC)	Хр. 19: 57.67 – 57.68 Mb	Хр. 7: 11.13 – 11.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALDLRTIFQ		CEPSENNLGS		ENSAFQQSQG		PAVQREEGIS		EFSRMVLNSF
QDSNNSYARQ		ELQRLYRIFH		SWLQPEKHSK		DEIISLLVLE		QFMIGGHCND
KASVKEKWKS		SGKNLERFIE		DLTDDSINPP		ALVHVHMQGQ		EALFSEDMPL
RDVIVHLTKQ		VNAQTTREAN		MGTPSQTSQD		TSLETGQGYE		DEQDGWNSSS
KTTRVNENIT		NQGNQIVSLI		IIQEENGPRP		EEGGVSSDNP		YNSKRAELVT
ARSQEGSING		ITFQGVPMVM		GAGCISQPEQ		SSPESALTHQ		SNEGNSTCEV
HQKGSHGVQK		SYKCEECPKV		FKYLCHLLAH		QRRHRNERPF		VCPECQKGFF
QISDLRVHQI		IHTGKKPFTC		SMCKKSFSHK		TNLRSHERIH		TGEKPYTCPF
CKTSYRQSST		YHRHMRTHEK		ITLPSVPSTP		EAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19