ZNF653

ZNF653 (англ. Zinc finger protein 653) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 615 амінокислот, а молекулярна маса — 67 235.

ZNF653
Ідентифікатори
Символи	ZNF653, E430039K05Rik, ZIP67, zinc finger protein 653
Зовнішні ІД	OMIM: 611371 MGI: 2442362 HomoloGene: 16346 GeneCards: ZNF653
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • transcription factor binding • receptor antagonist activity • AF-2 domain binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • extracellular region • клітинне ядро • компонент клітини Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • extracellular negative regulation of signal transduction • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of signaling receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	115950	319601
Ensembl	ENSG00000161914	ENSMUSG00000038895
UniProt	Q96CK0	Q6YND2
RefSeq (мРНК)	NM_138783	NM_177318 NM_001310759
RefSeq (білок)	NP_620138	NP_001297688 NP_796292
Локус (UCSC)	Хр. 19: 11.48 – 11.51 Mb	Хр. 9: 21.97 – 21.98 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAERALEPEA		EAEAEAGAGG		EAAAEEGAAG		RKARGRPRLT		ESDRARRRLE
SRKKYDVRRV		YLGEAHGPWV		DLRRRSGWSD		AKLAAYLISL		ERGQRSGRHG
KPWEQVPKKP		KRKKRRRRNV		NCLKNVVIWY		EDHKHRCPYE		PHLAELDPTF
GLYTTAVWQC		EAGHRYFQDL		HSPLKPLSDS		DPDSDKVGNG		LVAGSSDSSS
SGSASDSEES		PEGQPVKAAA		AAAAATPTSP		VGSSGLITQE		GVHIPFDVHH
VESLAEQGTP		LCSNPAGNGP		EALETVVCVP		VPVQVGAGPS		ALFENVPQEA
LGEVVASCPM		PGMVPGSQVI		IIAGPGYDAL		TAEGIHLNMA		AGSGVPGSGL
GEEVPCAMME		GVAAYTQTEP		EGSQPSTMDA		TAVAGIETKK		EKEDLCLLKK
EEKEEPVAPE		LATTVPESAE		PEAEADGEEL		DGSDMSAIIY		EIPKEPEKRR
RSKRSRVMDA		DGLLEMFHCP		YEGCSQVYVA		LSSFQNHVNL		VHRKGKTKVC
PHPGCGKKFY		LSNHLRRHMI		IHSGVREFTC		ETCGKSFKRK		NHLEVHRRTH
TGETPLQCEI		CGYQCRQRAS		LNWHMKKHTA		EVQYNFTCDR		CGKRFEKLDS
VKFHTLKSHP		DHKPT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Borud B., Mellgren G., Lund J., Bakke M. (2003). Cloning and characterization of a novel zinc finger protein that modulates the transcriptional activity of nuclear receptors. Mol. Endocrinol. 17: 2303—2319. PMID 12920234 DOI:10.1210/me.2003-0158
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19