ZNF473

ZNF473 (англ. Zinc finger protein 473) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 871 амінокислот, а молекулярна маса — 100 182.

ZNF473
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EMB, 2EMC, 2EME, 2EOU, 2EOX, 2EOY, 2EOZ, 2YRH, 2YRJ, 2YSV, 2YTD, 2YTE, 2YTT, 2YU5
Ідентифікатори
Символи	ZNF473, HZFP100, ZN473, zinc finger protein 473, ZFP100
Зовнішні ІД	OMIM: 617908 MGI: 2442697 HomoloGene: 18698 GeneCards: ZNF473
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • DNA binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • Тільце Кахаля • клітинне ядро • внутрішньоклітинний • Нуклеоплазма Біологічний процес • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA 3'-end processing by stem-loop binding and cleavage • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • histone mRNA metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25888	243963
Ensembl	ENSG00000142528	ENSMUSG00000048012
UniProt	Q8WTR7	Q8BI67
RefSeq (мРНК)	NM_001006656 NM_001308424 NM_015428	NM_001289836 NM_001289837 NM_001289838 NM_001289839 NM_178734
RefSeq (білок)	NP_001006657 NP_001295353 NP_056243	NP_001276765 NP_001276766 NP_001276767 NP_001276768 NP_848849
Локус (UCSC)	Хр. 19: 50.03 – 50.05 Mb	Хр. 7: 44.38 – 44.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEEFVTLKD		VGMDFTLGDW		EQLGLEQGDT		FWDTALDNCQ		DLFLLDPPRP
NLTSHPDGSE		DLEPLAGGSP		EATSPDVTET		KNSPLMEDFF		EEGFSQEIIE
MLSKDGFWNS		NFGEACIEDT		WLDSLLGDPE		SLLRSDIATN		GESPTECKSH
ELKRGLSPVS		TVSTGEDSMV		HNVSEKTLTP		AKSKEYRGEF		FSYSDHSQQD
SVQEGEKPYQ		CSECGKSFSG		SYRLTQHWIT		HTREKPTVHQ		ECEQGFDRNA
SLSVYPKTHT		GYKFYVCNEY		GTTFSQSTYL		WHQKTHTGEK		PCKSQDSDHP
PSHDTQPGEH		QKTHTDSKSY		NCNECGKAFT		RIFHLTRHQK		IHTRKRYECS
KCQATFNLRK		HLIQHQKTHA		AKTTSECQEC		GKIFRHSSLL		IEHQALHAGE
EPYKCNERGK		SFRHNSTLKI		HQRVHSGEKP		YKCSECGKAF		HRHTHLNEHR
RIHTGYRPHK		CQECVRSFSR		PSHLMRHQAI		HTAEKPYSCA		ECKETFSDNN
RLVQHQKMHT		VKTPYECQEC		GERFICGSTL		KCHESVHARE		KQGFFVSGKI
LDQNPEQKEK		CFKCNKCEKT		FSCSKYLTQH		ERIHTRGVKP		FECDQCGKAF
GQSTRLIHHQ		RIHSRVRLYK		WGEQGKAISS		ASLIKLQSFH		TKEHPFKCNE
CGKTFSHSAH		LSKHQLIHAG		ENPFKCSKCD		RVFTQRNYLV		QHERTHARKK
PLVCNECGKT		FRQSSCLSKH		QRIHSGEKPY		VCDYCGKAFG		LSAELVRHQR
IHTGEKPYVC		QECGKAFTQS		SCLSIHRRVH		TGEKPYRCGE		CGKAFAQKAN
LTQHQRIHTG		EKPYSCNVCG		KAFVLSAHLN		QHLRVHTQET		LYQCQRCQKA
FRCHSSLSRH		QRVHNKQQYC		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Dominski Z., Erkmann J.A., Yang X., Sanchez R., Marzluff W.F. (2002). A novel zinc finger protein is associated with U7 snRNP and interacts with the stem-loop binding protein in the histone pre-mRNP to stimulate 3'-end processing. Genes Dev. 16: 58—71. PMID 11782445 DOI:10.1101/gad.932302
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Azzouz T.N., Gruber A., Schuemperli D. (2005). U7 snRNP-specific Lsm11 protein: dual binding contacts with the 100 kDa zinc finger processing factor (ZFP100) and a ZFP100-independent function in histone RNA 3'-end processing. Nucleic Acids Res. 33: 2106—2117. PMID 15824063 DOI:10.1093/nar/gki516
• Wagner E.J., Marzluff W.F. (2006). ZFP100, a component of the active U7 snRNP limiting for histone pre-mRNA processing, is required for entry into S phase. Mol. Cell. Biol. 26: 6702—6712. PMID 16914750 DOI:10.1128/MCB.00391-06

Див. також

• Хромосома 19