ZNF394

ZNF394 (англ. Zinc finger protein 394) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 561 амінокислот, а молекулярна маса — 64 256.

ZNF394
Ідентифікатори
Символи	ZNF394, ZKSCAN14, ZSCAN46, zinc finger protein 394
Зовнішні ІД	MGI: 1914485 HomoloGene: 11342 GeneCards: ZNF394
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро Біологічний процес • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84124	67235
Ensembl	ENSG00000160908	ENSMUSG00000029627
UniProt	Q53GI3	Q9Z1D9
RefSeq (мРНК)	NM_032164 NM_001345967 NM_001345968	NM_023322
RefSeq (білок)	NP_001332896 NP_001332897 NP_115540	NP_075811
Локус (UCSC)	Хр. 7: 99.47 – 99.5 Mb	Хр. 5: 145.13 – 145.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNSSLTAQRR		GSDAELGPWV		MAARSKDAAP		SQRDGLLPVK		VEEDSPGSWE
PNYPAASPDP		ETSRLHFRQL		RYQEVAGPEE		ALSRLRELCR		RWLRPELLSK
EQILELLVLE		QFLTILPEEL		QAWVREHCPE		SGEEAVAVVR		ALQRALDGTS
SQGMVTFEDT		AVSLTWEEWE		RLDPARRDFC		RESAQKDSGS		TVPPSLESRV
ENKELIPMQQ		ILEEAEPQGQ		LQEAFQGKRP		LFSKCGSTHE		DRVEKQSGDP
LPLKLENSPE		AEGLNSISDV		NKNGSIEGED		SKNNELQNSA		RCSNLVLCQH
IPKAERPTDS		EEHGNKCKQS		FHMVTWHVLK		PHKSDSGDSF		HHSSLFETQR
QLHEERPYKC		GNCGKSFKQR		SDLFRHQRIH		TGEKPYGCQE		CGKSFSQSAA
LTKHQRTHTG		EKPYTCLKCG		ERFRQNSHLN		RHQSTHSRDK		HFKCEECGET
CHISNLFRHQ		RLHKGERPYK		CEECEKSFKQ		RSDLFKHHRI		HTGEKPYGCS
VCGKRFNQSA		TLIKHQRIHT		GEKPYKCLEC		GERFRQSTHL		IRHQRIHQNK
VLSAGRGGSR		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pengue G., Calabro V., Bartoli P.C., Pagliuca A., Lania L. (1994). Repression of transcriptional activity at a distance by the evolutionarily conserved KRAB domain present in a subfamily of zinc finger proteins. Nucleic Acids Res. 22: 2908—2914. PMID 8065901 DOI:10.1093/nar/22.15.2908

Див. також

• Хромосома 7