ZKSCAN4

ZKSCAN4 (англ. Zinc finger with KRAB and SCAN domains 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 545 амінокислот, а молекулярна маса — 61 579.

ZKSCAN4
Ідентифікатори
Символи	ZKSCAN4, P1P373C6, ZNF307, ZNF427, ZSCAN36, p373c6.1, zinc finger with KRAB and SCAN domains 4
Зовнішні ІД	OMIM: 611643 MGI: 1919989 HomoloGene: 56845 GeneCards: ZKSCAN4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	387032	72739
Ensembl	ENSG00000187626	ENSMUSG00000021327
UniProt	Q969J2	Q91VW9
RefSeq (мРНК)	NM_001304506 NM_019110	NM_001145778 NM_023685 NM_001368182
RefSeq (білок)	NP_001291435 NP_061983	NP_001139250 NP_076174 NP_001355111
Локус (UCSC)	Хр. 6: 28.24 – 28.25 Mb	Хр. 13: 21.57 – 21.59 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAREPRKNAA		LDAQSAEDQT		GLLTVKVEKE		EASALTAEVR		APCSPARGPE
RSRQRFRGFR		YPEAAGPREA		LSRLRELCGQ		WLQPEMHSKE		QILELLVLEQ
FLTILPGNLQ		SWVREQHPES		GEEVVVLLEY		LERQLDEPAP		QVPVGDQGQE
LLCCKMALLT		QTQGSQSSQC		QPMKALFKHE		SLGSQPLHDR		VLQVPGLAQG
GCCREDAMVA		SRLTPGSQGL		LKMEDVALTL		TPGWTQLDSS		QVNLYRDEKQ
ENHSSLVSLG		GEIQTKSRDL		PPVKKLPEKE		HGKICHLRED		IAQIPTHAEA
GEQEGRLQRK		QKNAIGSRRH		YCHECGKSFA		QSSGLTKHRR		IHTGEKPYEC
EDCGKTFIGS		SALVIHQRVH		TGEKPYECEE		CGKVFSHSSN		LIKHQRTHTG
EKPYECDDCG		KTFSQSCSLL		EHHKIHTGEK		PYQCNMCGKA		FRRNSHLLRH
QRIHGDKNVQ		NPEHGESWES		QGRTESQWEN		TEAPVSYKCN		ECERSFTRNR
SLIEHQKIHT		GEKPYQCDTC		GKGFTRTSYL		VQHQRSHVGK		KTLSQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 6