ZFR

ZFR
Ідентифікатори
Символи	ZFR, SPG71, ZFR1, zinc finger RNA binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 615635 MGI: 1341890 HomoloGene: 8009 GeneCards: ZFR
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • zinc ion binding; • RNA binding; • double-stranded RNA binding; • single-stranded RNA binding;
Клітинна компонента	• хромосома; • цитоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• multicellular organism development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	51663
	22763
	ENSG00000056097
	ENSMUSG00000022201
	Q96KR1
	O88532
	NM_016107
	NM_011767; NM_001358823
	NP_057191
	NP_035897; NP_001345752
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ZFR (англ. Zinc finger RNA binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 074 амінокислот, а молекулярна маса — 117 012^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MIPICPVVSF	TYVPSRLGED	AKMATGNYFG	FTHSGAAAAA	AAAQYSQQPA
SGVAYSHPTT	VASYTVHQAP	VAAHTVTAAY	APAAATVAVA	RPAPVAVAAA
ATAAAYGGYP	TAHTATDYGY	TQRQQEAPPP	PPPATTQNYQ	DSYSYVRSTA
PAVAYDSKQY	YQQPTATAAA	VAAAAQPQPS	VAETYYQTAP	KAGYSQGATQ
YTQAQQTRQV	TAIKPATPSP	ATTTFSIYPV	SSTVQPVAAA	ATVVPSYTQS
ATYSTTAVTY	SGTSYSGYEA	AVYSAASSYY	QQQQQQQKQA	AAAAAAAAAT
AAWTGTTFTK	KAPFQNKQLK	PKQPPKPPQI	HYCDVCKISC	AGPQTYKEHL
EGQKHKKKEA	ALKASQNTSS	SNSSTRGTQN	QLRCELCDVS	CTGADAYAAH
IRGAKHQKVV	KLHTKLGKPI	PSTEPNVVSQ	ATSSTAVSAS	KPTASPSSIA
ANNCTVNTSS	VATSSMKGLT	TTGNSSLNST	SNTKVSAVPT	NMAAKKTSTP
KINFVGGNKL	QSTGNKAEDI	KGTECVKSTP	VTSAVQIPEV	KQDTVSEPVT
PASLAALQSD	VQPVGHDYVE	EVRNDEGKVI	RFHCKLCECS	FNDPNAKEMH
LKGRRHRLQY	KKKVNPDLQV	EVKPSIRARK	IQEEKMRKQM	QKEEYWRRRE
EEERWRMEMR	RYEEDMYWRR	MEEEQHHWDD	RRRMPDGGYP	HGPPGPLGLL
GVRPGMPPQP	QGPAPLRRPD	SSDDRYVMTK	HATIYPTEEE	LQAVQKIVSI
TERALKLVSD	SLSEHEKNKN	KEGDDKKEGG	KDRALKGVLR	VGVLAKGLLL
RGDRNVNLVL	LCSEKPSKTL	LSRIAENLPK	QLAVISPEKY	DIKCAVSEAA
IILNSCVEPK	MQVTITLTSP	IIREENMREG	DVTSGMVKDP	PDVLDRQKCL
DALAALRHAK	WFQARANGLQ	SCVIIIRILR	DLCQRVPTWS	DFPSWAMELL
VEKAISSASS	PQSPGDALRR	VFECISSGII	LKGSPGLLDP	CEKDPFDTLA
TMTDQQREDI	TSSAQFALRL	LAFRQIHKVL	GMDPLPQMSQ	RFNIHNNRKR
RRDSDGVDGF	EAEGKKDKKD	YDNF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література ред.

Kleines M., Gaertner A., Ritter K., Schaade L. (2001). Cloning and expression of the human single copy homologue of the mouse zinc finger protein zfr. Gene. 275: 157—162. PMID 11574164 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00620-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17277 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96KR1 (англ.) . Архів оригіналу за 30 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також ред.

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17277 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q96KR1 (англ.) . Архів оригіналу за 30 вересня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]