USP5

USP5 (англ. Ubiquitin specific peptidase 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 858 амінокислот, а молекулярна маса — 95 786.

USP5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DAG, 2DAK, 2G43, 2G45, 3IHP
Ідентифікатори
Символи	USP5, ISOT, ubiquitin specific peptidase 5
Зовнішні ІД	OMIM: 601447 MGI: 1347343 HomoloGene: 55758 GeneCards: USP5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • zinc ion binding • ubiquitin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • thiol-dependent deubiquitinase Клітинна компонента • лізосома • гіалоплазма Біологічний процес • protein K48-linked deubiquitination • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • protein deubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8078	22225
Ensembl	ENSG00000111667	ENSMUSG00000038429
UniProt	P45974	P56399
RefSeq (мРНК)	NM_001098536 NM_003481	NM_013700 NM_001326594
RefSeq (білок)	NP_001092006 NP_003472 NP_001369517 NP_001369518 NP_001369519 NP_001369520	NP_001313523 NP_038728
Локус (UCSC)	Хр. 12: 6.85 – 6.87 Mb	Хр. 6: 124.79 – 124.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAELSEEALL		SVLPTIRVPK		AGDRVHKDEC		AFSFDTPESE		GGLYICMNTF
LGFGKQYVER		HFNKTGQRVY		LHLRRTRRPK		EEDPATGTGD		PPRKKPTRLA
IGVEGGFDLS		EEKFELDEDV		KIVILPDYLE		IARDGLGGLP		DIVRDRVTSA
VEALLSADSA		SRKQEVQAWD		GEVRQVSKHA		FSLKQLDNPA		RIPPCGWKCS
KCDMRENLWL		NLTDGSILCG		RRYFDGSGGN		NHAVEHYRET		GYPLAVKLGT
ITPDGADVYS		YDEDDMVLDP		SLAEHLSHFG		IDMLKMQKTD		KTMTELEIDM
NQRIGEWELI		QESGVPLKPL		FGPGYTGIRN		LGNSCYLNSV		VQVLFSIPDF
QRKYVDKLEK		IFQNAPTDPT		QDFSTQVAKL		GHGLLSGEYS		KPVPESGDGE
RVPEQKEVQD		GIAPRMFKAL		IGKGHPEFST		NRQQDAQEFF		LHLINMVERN
CRSSENPNEV		FRFLVEEKIK		CLATEKVKYT		QRVDYIMQLP		VPMDAALNKE
ELLEYEEKKR		QAEEEKMALP		ELVRAQVPFS		SCLEAYGAPE		QVDDFWSTAL
QAKSVAVKTT		RFASFPDYLV		IQIKKFTFGL		DWVPKKLDVS		IEMPEELDIS
QLRGTGLQPG		EEELPDIAPP		LVTPDEPKGS		LGFYGNEDED		SFCSPHFSSP
TSPMLDESVI		IQLVEMGFPM		DACRKAVYYT		GNSGAEAAMN		WVMSHMDDPD
FANPLILPGS		SGPGSTSAAA		DPPPEDCVTT		IVSMGFSRDQ		ALKALRATNN
SLERAVDWIF		SHIDDLDAEA		AMDISEGRSA		ADSISESVPV		GPKVRDGPGK
YQLFAFISHM		GTSTMCGHYV		CHIKKEGRWV		IYNDQKVCAS		EKPPKDLGYI
YFYQRVAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• Ansari-Lari M.A., Shen Y., Muzny D.M., Lee W., Gibbs R.A. (1997). Large-scale sequencing in human chromosome 12p13: experimental and computational gene structure determination. Genome Res. 7: 268—280. PMID 9074930 DOI:10.1101/gr.7.3.268
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Reyes-Turcu F.E., Shanks J.R., Komander D., Wilkinson K.D. (2008). Recognition of polyubiquitin isoforms by the multiple ubiquitin binding modules of isopeptidase T. J. Biol. Chem. 283: 19581—19592. PMID 18482987 DOI:10.1074/jbc.M800947200
• Zhang Y.H., Zhou C.J., Zhou Z.R., Song A.X., Hu H.Y. (2011). Domain analysis reveals that a deubiquitinating enzyme USP13 performs non-activating catalysis for Lys63-linked polyubiquitin. PLoS ONE. 6: E29362—E29362. PMID 22216260 DOI:10.1371/journal.pone.0029362

Див. також

• Хромосома 12