USP4

USP4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2Y6E, 5CTR
Ідентифікатори
Символи	USP4, UNP, Unph, ubiquitin specific peptidase 4
Зовнішні ІД	OMIM: 603486 MGI: 98905 HomoloGene: 20716 GeneCards: USP4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity; • adenosine receptor binding; • hydrolase activity; • thiol-dependent deubiquitinase; • зв'язування з іоном металу; • cysteine-type peptidase activity; • identical protein binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • лізосома; • клітинна мембрана; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• ubiquitin-dependent protein catabolic process; • spliceosomal tri-snRNP complex assembly; • regulation of protein stability; • протеоліз; • negative regulation of protein ubiquitination; • protein localization to cell surface; • protein deubiquitination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7375
	22258
	ENSG00000114316
	ENSMUSG00000032612
	Q13107
	P35123
	NM_199443; NM_001251877; NM_003363
	NM_011678; NM_001311157
	NP_001238806; NP_003354; NP_955475
	NP_001298086; NP_035808
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

USP4 (англ. Ubiquitin specific peptidase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 108 565^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEGGGCRER	PDAETQKSEL	GPLMRTTLQR	GAQWYLIDSR	WFKQWKKYVG
FDSWDMYNVG	EHNLFPGPID	NSGLFSDPES	QTLKEHLIDE	LDYVLVPTEA
WNKLLNWYGC	VEGQQPIVRK	VVEHGLFVKH	CKVEVYLLEL	KLCENSDPTN
VLSCHFSKAD	TIATIEKEMR	KLFNIPAERE	TRLWNKYMSN	TYEQLSKLDN
TVQDAGLYQG	QVLVIEPQNE	DGTWPRQTLQ	SKSSTAPSRN	FTTSPKSSAS
PYSSVSASLI	ANGDSTSTCG	MHSSGVSRGG	SGFSASYNCQ	EPPSSHIQPG
LCGLGNLGNT	CFMNSALQCL	SNTAPLTDYF	LKDEYEAEIN	RDNPLGMKGE
IAEAYAELIK	QMWSGRDAHV	APRMFKTQVG	RFAPQFSGYQ	QQDSQELLAF
LLDGLHEDLN	RVKKKPYLEL	KDANGRPDAV	VAKEAWENHR	LRNDSVIVDT
FHGLFKSTLV	CPECAKVSVT	FDPFCYLTLP	LPLKKDRVME	VFLVPADPHC
RPTQYRVTVP	LMGAVSDLCE	ALSRLSGIAA	ENMVVADVYN	HRFHKIFQMD
EGLNHIMPRD	DIFVYEVCST	SVDGSECVTL	PVYFRERKSR	PSSTSSASAL
YGQPLLLSVP	KHKLTLESLY	QAVCDRISRY	VKQPLPDEFG	SSPLEPGACN
GSRNSCEGED	EEEMEHQEEG	KEQLSETEGS	GEDEPGNDPS	ETTQKKIKGQ
PCPKRLFTFS	LVNSYGTADI	NSLAADGKLL	KLNSRSTLAM	DWDSETRRLY
YDEQESEAYE	KHVSMLQPQK	KKKTTVALRD	CIELFTTMET	LGEHDPWYCP
NCKKHQQATK	KFDLWSLPKI	LVVHLKRFSY	NRYWRDKLDT	VVEFPIRGLN
MSEFVCNLSA	RPYVYDLIAV	SNHYGAMGVG	HYTAYAKNKL	NGKWYYFDDS
NVSLASEDQI	VTKAAYVLFY	QRRDDEFYKT	PSLSSSGSSD	GGTRPSSSQQ
GFGDDEACSM	DTN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Frederick A., Rolfe M., Chiu M.I. (1998). The human UNP locus at 3p21.31 encodes two tissue-selective, cytoplasmic isoforms with deubiquitinating activity that have reduced expression in small cell lung carcinoma cell lines. Oncogene. 16: 153—165. PMID 9464533 DOI:10.1038/sj.onc.1201537
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wada K., Tanji K., Kamitani T. (2006). Oncogenic protein UnpEL/Usp4 deubiquitinates Ro52 by its isopeptidase activity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 339: 731—736. PMID 16316627 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.11.076
Wada K., Kamitani T. (2006). UnpEL/Usp4 is ubiquitinated by Ro52 and deubiquitinated by itself. Biochem. Biophys. Res. Commun. 342: 253—258. PMID 16472766 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.01.144
Uras I.Z., List T., Nijman S.M. (2012). Ubiquitin-specific protease 4 inhibits mono-ubiquitination of the master growth factor signaling kinase PDK1. PLoS ONE. 7: E31003—E31003. PMID 22347420 DOI:10.1371/journal.pone.0031003

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12627 (англ.) . Архів оригіналу за 15 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q13107 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12627 (англ.) . Архів оригіналу за 15 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q13107 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]