USP38
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
USP38 (англ. Ubiquitin specific peptidase 38) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 042 амінокислот, а молекулярна маса — 116 546[4].
USP38 | |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||
Ідентифікатори | |||||||||||||||
Символи | USP38, HP43.8KD, ubiquitin specific peptidase 38 | ||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 618322 MGI: 1922091 HomoloGene: 12367 GeneCards: USP38 | ||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 4: 143.18 – 143.22 Mb | Хр. 8: 81.71 – 81.74 Mb | |||||||||||||
PubMed search | [1] | [2] | |||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MDKILEGLVS | SSHPLPLKRV | IVRKVVESAE | HWLDEAQCEA | MFDLTTRLIL | ||||
EGQDPFQRQV | GHQVLEAYAR | YHRPEFESFF | NKTFVLGLLH | QGYHSLDRKD | ||||
VAILDYIHNG | LKLIMSCPSV | LDLFSLLQVE | VLRMVCERPE | PQLCARLSDL | ||||
LTDFVQCIPK | GKLSITFCQQ | LVRTIGHFQC | VSTQERELRE | YVSQVTKVSN | ||||
LLQNIWKAEP | ATLLPSLQEV | FASISSTDAS | FEPSVALASL | VQHIPLQMIT | ||||
VLIRSLTTDP | NVKDASMTQA | LCRMIDWLSW | PLAQHVDTWV | IALLKGLAAV | ||||
QKFTILIDVT | LLKIELVFNR | LWFPLVRPGA | LAVLSHMLLS | FQHSPEAFHL | ||||
IVPHVVNLVH | SFKNDGLPSS | TAFLVQLTEL | IHCMMYHYSG | FPDLYEPILE | ||||
AIKDFPKPSE | EKIKLILNQS | AWTSQSNSLA | SCLSRLSGKS | ETGKTGLINL | ||||
GNTCYMNSVI | QALFMATDFR | RQVLSLNLNG | CNSLMKKLQH | LFAFLAHTQR | ||||
EAYAPRIFFE | ASRPPWFTPR | SQQDCSEYLR | FLLDRLHEEE | KILKVQASHK | ||||
PSEILECSET | SLQEVASKAA | VLTETPRTSD | GEKTLIEKMF | GGKLRTHIRC | ||||
LNCRSTSQKV | EAFTDLSLAF | CPSSSLENMS | VQDPASSPSI | QDGGLMQASV | ||||
PGPSEEPVVY | NPTTAAFICD | SLVNEKTIGS | PPNEFYCSEN | TSVPNESNKI | ||||
LVNKDVPQKP | GGETTPSVTD | LLNYFLAPEI | LTGDNQYYCE | NCASLQNAEK | ||||
TMQITEEPEY | LILTLLRFSY | DQKYHVRRKI | LDNVSLPLVL | ELPVKRITSF | ||||
SSLSESWSVD | VDFTDLSENL | AKKLKPSGTD | EASCTKLVPY | LLSSVVVHSG | ||||
ISSESGHYYS | YARNITSTDS | SYQMYHQSEA | LALASSQSHL | LGRDSPSAVF | ||||
EQDLENKEMS | KEWFLFNDSR | VTFTSFQSVQ | KITSRFPKDT | AYVLLYKKQH | ||||
STNGLSGNNP | TSGLWINGDP | PLQKELMDAI | TKDNKLYLQE | QELNARARAL | ||||
QAASASCSFR | PNGFDDNDPP | GSCGPTGGGG | GGGFNTVGRL | VF |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20067 (англ.) . Архів оригіналу за 15 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, Q8NB14 (англ.) . Архів оригіналу за 4 лютого 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |