USP2

USP2 (англ. Ubiquitin specific peptidase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 605 амінокислот, а молекулярна маса — 68 072.

USP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2HD5, 2IBI, 3NHE, 3V6C, 3V6E
Ідентифікатори
Символи	USP2, UBP41, USP9, ubiquitin specific peptidase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604725 MGI: 1858178 HomoloGene: 3098 GeneCards: USP2
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • cysteine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • ubiquitin protein ligase binding • cyclin binding • thiol-dependent deubiquitinase Клітинна компонента • цитоплазма • центросома • cell cortex • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • нуклеоплазма • мембрана Біологічний процес • ubiquitin-dependent protein catabolic process • ритмічний процес • muscle organ development • protein stabilization • positive regulation of mitotic cell cycle • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • circadian regulation of gene expression • протеоліз • circadian behavior • клітинний цикл • entrainment of circadian clock by photoperiod • locomotor rhythm • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9099	53376
Ensembl	ENSG00000036672	ENSMUSG00000032010
UniProt	O75604	O88623
RefSeq (мРНК)	NM_001243759 NM_004205 NM_171997	NM_016808 NM_198091 NM_198092
RefSeq (білок)	NP_001230688 NP_004196 NP_741994	NP_058088 NP_932759 NP_932760 NP_001394747 NP_001394748 NP_001394749 NP_001394750 NP_001394751 NP_001394752 NP_001394753 NP_001394754 NP_001394755 NP_001394756
Локус (UCSC)	Хр. 11: 119.36 – 119.38 Mb	Хр. 9: 44.07 – 44.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQLSSTLKR		YTESARYTDA		HYAKSGYGAY		TPSSYGANLA		ASLLEKEKLG
FKPVPTSSFL		TRPRTYGPSS		LLDYDRGRPL		LRPDITGGGK		RAESQTRGTE
RPLGSGLSGG		SGFPYGVTNN		CLSYLPINAY		DQGVTLTQKL		DSQSDLARDF
SSLRTSDSYR		IDPRNLGRSP		MLARTRKELC		TLQGLYQTAS		CPEYLVDYLE
NYGRKGSASQ		VPSQAPPSRV		PEIISPTYRP		IGRYTLWETG		KGQAPGPSRS
SSPGRDGMNS		KSAQGLAGLR		NLGNTCFMNS		ILQCLSNTRE		LRDYCLQRLY
MRDLHHGSNA		HTALVEEFAK		LIQTIWTSSP		NDVVSPSEFK		TQIQRYAPRF
VGYNQQDAQE		FLRFLLDGLH		NEVNRVTLRP		KSNPENLDHL		PDDEKGRQMW
RKYLEREDSR		IGDLFVGQLK		SSLTCTDCGY		CSTVFDPFWD		LSLPIAKRGY
PEVTLMDCMR		LFTKEDVLDG		DEKPTCCRCR		GRKRCIKKFS		IQRFPKILVL
HLKRFSESRI		RTSKLTTFVN		FPLRDLDLRE		FASENTNHAV		YNLYAVSNHS
GTTMGGHYTA		YCRSPGTGEW		HTFNDSSVTP		MSSSQVRTSD		AYLLFYELAS
PPSRM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, біологічні ритми, убіквітинування білків, міогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shan J., Zhao W., Gu W. (2009). Suppression of cancer cell growth by promoting cyclin D1 degradation. Mol. Cell. 36: 469—476. PMID 19917254 DOI:10.1016/j.molcel.2009.10.018
• Allende-Vega N., Sparks A., Lane D.P., Saville M.K. (2010). MdmX is a substrate for the deubiquitinating enzyme USP2a. Oncogene. 29: 432—441. PMID 19838211 DOI:10.1038/onc.2009.330

Див. також

• Хромосома 11