USP12

USP12 (англ. Ubiquitin specific peptidase 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 370 амінокислот, а молекулярна маса — 42 858.

USP12
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5K1A, 5K1B, 5K16
Ідентифікатори
Символи	USP12, UBH1, USP12L1, ubiquitin specific peptidase 12
Зовнішні ІД	OMIM: 603091 MGI: 1270128 HomoloGene: 56137 GeneCards: USP12
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • cysteine-type peptidase activity • thiol-dependent deubiquitinase • cysteine-type endopeptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904265 deubiquitinase activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • компонент клітини Біологічний процес • ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • protein deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	219333	22217
Ensembl	ENSG00000152484	ENSMUSG00000029640
UniProt	O75317	Q9D9M2
RefSeq (мРНК)	NM_182488	NM_011669
RefSeq (білок)	NP_872294	NP_035799
Локус (UCSC)	Хр. 13: 27.07 – 27.17 Mb	Хр. 5: 146.67 – 146.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEILMTVSKF		ASICTMGANA		SALEKEIGPE		QFPVNEHYFG		LVNFGNTCYC
NSVLQALYFC		RPFREKVLAY		KSQPRKKESL		LTCLADLFHS		IATQKKKVGV
IPPKKFITRL		RKENELFDNY		MQQDAHEFLN		YLLNTIADIL		QEERKQEKQN
GRLPNGNIDN		ENNNSTPDPT		WVHEIFQGTL		TNETRCLTCE		TISSKDEDFL
DLSVDVEQNT		SITHCLRGFS		NTETLCSEYK		YYCEECRSKQ		EAHKRMKVKK
LPMILALHLK		RFKYMDQLHR		YTKLSYRVVF		PLELRLFNTS		GDATNPDRMY
DLVAVVVHCG		SGPNRGHYIA		IVKSHDFWLL		FDDDIVEKID		AQAIEEFYGL
TSDISKNSES		GYILFYQSRD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cohn M.A., Kee Y., Haas W., Gygi S.P., D'Andrea A.D. (2009). UAF1 is a subunit of multiple deubiquitinating enzyme complexes. J. Biol. Chem. 284: 5343—5351. PMID 19075014 DOI:10.1074/jbc.M808430200
• Gangula N.R., Maddika S. (2013). WD repeat protein WDR48 in complex with deubiquitinase USP12 suppresses Akt-dependent cell survival signaling by stabilizing PH domain leucine-rich repeat protein phosphatase 1 (PHLPP1). J. Biol. Chem. 288: 34545—34554. PMID 24145035 DOI:10.1074/jbc.M113.503383
• Dharadhar S., Clerici M., van Dijk W.J., Fish A., Sixma T.K. (2016). A conserved two-step binding for the UAF1 regulator to the USP12 deubiquitinating enzyme. J. Struct. Biol. 196: 437—447. PMID 27650958 DOI:10.1016/j.jsb.2016.09.011

Див. також

• Хромосома 13