UHRF2

UHRF2 (англ. Ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 802 амінокислот, а молекулярна маса — 89 985.

UHRF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WY8, 1Z6U, 2E6S, 3OLN, 4PW5, 4PW6, 4PW7, 4TVR
Ідентифікатори
Символи	UHRF2, NIRF, RNF107, URF2, TDRD23, ubiquitin like with PHD and ring finger domains 2
Зовнішні ІД	OMIM: 615211 MGI: 1923718 HomoloGene: 17001 GeneCards: UHRF2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0031493 histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • SUMO transferase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • protein autoubiquitination • regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • клітинний цикл • диференціація клітин • проліферація • maintenance of DNA methylation • Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of cell cycle • protein sumoylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	115426	109113
Ensembl	ENSG00000147854	ENSMUSG00000024817
UniProt	Q96PU4	Q7TMI3
RefSeq (мРНК)	NM_152896 NM_152306	NM_144873
RefSeq (білок)	NP_690856	NP_659122
Локус (UCSC)	Хр. 9: 6.41 – 6.51 Mb	Хр. 19: 30.01 – 30.07 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWIQVRTIDG		SKTCTIEDVS		RKATIEELRE		RVWALFDVRP		ECQRLFYRGK
QLENGYTLFD		YDVGLNDIIQ		LLVRPDPDHL		PGTSTQIEAK		PCSNSPPKVK
KAPRVGPSNQ		PSTSARARLI		DPGFGIYKVN		ELVDARDVGL		GAWFEAHIHS
VTRASDGQSR		GKTPLKNGSS		CKRTNGNIKH		KSKENTNKLD		SVPSTSNSDC
VAADEDVIYH		IQYDEYPESG		TLEMNVKDLR		PRARTILKWN		ELNVGDVVMV
NYNVESPGQR		GFWFDAEITT		LKTISRTKKE		LRVKIFLGGS		EGTLNDCKII
SVDEIFKIER		PGAHPLSFAD		GKFLRRNDPE		CDLCGGDPEK		KCHSCSCRVC
GGKHEPNMQL		LCDECNVAYH		IYCLNPPLDK		VPEEEYWYCP		SCKTDSSEVV
KAGERLKMSK		KKAKMPSAST		ESRRDWGRGM		ACVGRTRECT		IVPSNHYGPI
PGIPVGSTWR		FRVQVSEAGV		HRPHVGGIHG		RSNDGAYSLV		LAGGFADEVD
RGDEFTYTGS		GGKNLAGNKR		IGAPSADQTL		TNMNRALALN		CDAPLDDKIG
AESRNWRAGK		PVRVIRSFKG		RKISKYAPEE		GNRYDGIYKV		VKYWPEISSS
HGFLVWRYLL		RRDDVEPAPW		TSEGIERSRR		LCLRLQYPAG		YPSDKEGKKP
KGQSKKQPSG		TTKRPISDDD		CPSASKVYKA		SDSAEAIEAF		QLTPQQQHLI
REDCQNQKLW		DEVLSHLVEG		PNFLKKLEQS		FMCVCCQELV		YQPVTTECFH
NVCKDCLQRS		FKAQVFSCPA		CRHDLGQNYI		MIPNEILQTL		LDLFFPGYSK
GR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Mori T., Li Y., Hata H., Ono K., Kochi H. (2002). NIRF, a novel RING finger protein, is involved in cell-cycle regulation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296: 530—536. PMID 12176013 DOI:10.1016/S0006-291X(02)00890-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Li Y., Mori T., Hata H., Homma Y., Kochi H. (2004). NIRF induces G1 arrest and associates with Cdk2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 319: 464—468. PMID 15178429 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.04.190
• Mori T., Li Y., Hata H., Kochi H. (2004). NIRF is a ubiquitin ligase that is capable of ubiquitinating PCNP, a PEST-containing nuclear protein. FEBS Lett. 557: 209—214. PMID 14741369 DOI:10.1016/S0014-5793(03)01495-9
• Unoki M., Nishidate T., Nakamura Y. (2004). ICBP90, an E2F-1 target, recruits HDAC1 and binds to methyl-CpG through its SRA domain. Oncogene. 23: 7601—7610. PMID 15361834 DOI:10.1038/sj.onc.1208053
• Mori T., Ikeda D.D., Fukushima T., Takenoshita S., Kochi H. (2011). NIRF constitutes a nodal point in the cell cycle network and is a candidate tumor suppressor. Cell Cycle. 10: 3284—3299. PMID 21952639 DOI:10.4161/cc.10.19.17176

Див. також

• Хромосома 9