TRERF1

TRERF1
Ідентифікатори
Символи	TRERF1, BCAR2, HSA277276, RAPA, TREP132, TReP-132, dJ139D8.5, transcriptional regulating factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610322 MGI: 2442086 HomoloGene: 14129 GeneCards: TRERF1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001104 transcription coregulator activity; • DNA binding; • DNA binding, bending; • nuclear receptor coactivator activity; • transcription factor binding; • nucleic acid binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • histone deacetylase complex; • transcription regulator complex; • нуклеоплазма; • ядерце; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • cholesterol catabolic process; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • homeostatic process; • steroid biosynthetic process; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • regulation of hormone biosynthetic process; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	55809
	224829
	ENSG00000124496
	ENSMUSG00000064043
	Q96PN7
	Q8BXJ2
NM_001297573; NM_018415; NM_033501; NM_033502; NM_001391983;
	NM_001391984; NM_001395490
	NM_001097623; NM_172622
	NP_001284502; NP_277037
	NP_001091092; NP_766210
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TRERF1 (англ. Transcriptional regulating factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 200 амінокислот, а молекулярна маса — 132 256^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGDQQLYKTN	HVAHGSENLF	YQQPPLGVHS	GLNHNYGNAV	TGGGMDAPQA
SPISPHFPQD	TRDGLGLPVG	SKNLGQMDTS	RQGGWGSHAG	PGNHVQLRGN
LANSNMMWGA	PAQAEPTDGY	QYTYSQASEI	RTQKLTSGVL	HKLDSFTQVF
ANQNLRIQVN	NMAQVLHTQS	AVMDGAPDSA	LRQLLSQKPM	EPPAPAIPSR
YQQVPQQPHP	GFTGGLSKPA	LQVGQHPTQG	HLYYDYQQPL	AQVPVQGGQP
LQAPQMLSQH	MQQMQQHQYY	PPQQQQQAGQ	QRISMQEIQT	QPQQIRPSQP
QPPPQQQQPQ	QLQLQQRQGS	MQIPQYYQPQ	PMMQHLQEQQ	QQQMHLQPPS
YHRDPHQYTP	EQAHTVQLIP	LGSMSQYYYQ	EPQQPYSHPL	YQQSHLSQHQ
QREDSQLKTY	SSDRQAQAML	SSHGDLGPPD	TGMGDPASSD	LTRVSSTLPH
RPLLSPSGIH	LNNMGPQHQQ	LSPSAMWPQM	HLPDGRAQPG	SPESSGQPKG
AFGEQFDAKN	KLTCSICLKE	FKNLPALNGH	MRSHGGMRAS	PNLKQEEGEK
VLPPQPQPPL	PPPPPPPPPP	QLPPEAESLT	PMVMPVSVPV	KLLPPKPSSQ
GFTNSTVAAP	SARDKPASSM	SDDEMPVLEI	PRKHQPSVPK	AEEPLKTVQE
KKKFRHRPEP	LFIPPPPSYN	PNPAASYSGA	TLYQSQLRSP	RVLGDHLLLD
PTHELPPYTP	PPMLSPVRQG	SGLFSNVLIS	GHGPGAHPQL	PLTPLTPTPR
VLLCRSNSID	GSNVTVTPGP	GEQTVDVEPR	INIGLRFQAE	IPELQDISAL
AQDTHKATLV	WKPWPELENH	DLQQRVENLL	NLCCSSALPG	GGTNSEFALH
SLFEAKGDVM	VALEMLLLRK	PVRLKCHPLA	NYHYAGSDKW	TSLERKLFNK
ALATYSKDFI	FVQKMVKSKT	VAQCVEYYYT	WKKIMRLGRK	HRTRLAEIID
DCVTSEEEEE	LEEEEEEDPE	EDRKSTKEEE	SEVPKSPEPP	PVPVLAPTEG
PPLQALGQPS	GSFICEMPNC	GAVFSSRQAL	NGHARIHGGT	NQVTKARGAI
PSGKQKPGGT	QSGYCSVKSS	PSHSTTSGET	DPTTIFPCKE	CGKVFFKIKS
RNAHMKTHRQ	QEEQQRQKAQ	KAAFAAEMAA	TIERTTGPVG	APGLLPLDQL
SLIKPIKDVD	ILDDDVVQQL	GGVMEEAEVV	DTDLLLDDQD	SVLLQGDAEL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Gizard F., Lavallee B., DeWitte F., Hum D.W. (2001). A novel zinc finger protein TReP-132 interacts with CBP/p300 to regulate human CYP11A1 gene expression. J. Biol. Chem. 276: 33881—33892. PMID 11349124 DOI:10.1074/jbc.M100113200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18273 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96PN7 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18273 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q96PN7 (англ.) . Архів оригіналу за 21 липня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]