TOP3A

TOP3A (англ. DNA topoisomerase III alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 001 амінокислот, а молекулярна маса — 112 372.

TOP3A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4CGY, 4CHT
Ідентифікатори
Символи	TOP3A, TOP3, ZGRF7, topoisomerase (DNA) III alpha, DNA topoisomerase III alpha, PEOB5, MGRISCE2
Зовнішні ІД	OMIM: 601243 MGI: 1197527 HomoloGene: 3394 GeneCards: TOP3A
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity • DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • isomerase activity • зв'язування з іоном металу • DNA topoisomerase activity • single-stranded DNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • PML body • нуклеоплазма • хромосома • клітинне ядро • мітохондрія • мітохондріальний матрикс Біологічний процес • реплікація ДНК • DNA topological change • GO:0007126 мейоз • mitochondrial DNA metabolic process • chromosome separation • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7156	21975
Ensembl	ENSG00000284238 ENSG00000177302	ENSMUSG00000002814
UniProt	Q13472	O70157
RefSeq (мРНК)	NM_004618 NM_001320759	NM_009410
RefSeq (білок)	NP_001307688 NP_004609	NP_033436
Локус (UCSC)	Хр. 17: 18.27 – 18.32 Mb	Хр. 11: 60.63 – 60.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIFPVARYAL		RWLRRPEDRA		FSRAAMEMAL		RGVRKVLCVA		EKNDAAKGIA
DLLSNGRMRR		REGLSKFNKI		YEFDYHLYGQ		NVTMVMTSVS		GHLLAHDFQM
QFRKWQSCNP		LVLFEAEIEK		YCPENFVDIK		KTLERETRQC		QALVIWTDCD
REGENIGFEI		IHVCKAVKPN		LQVLRARFSE		ITPHAVRTAC		ENLTEPDQRV
SDAVDVRQEL		DLRIGAAFTR		FQTLRLQRIF		PEVLAEQLIS		YGSCQFPTLG
FVVERFKAIQ		AFVPEIFHRI		KVTHDHKDGI		VEFNWKRHRL		FNHTACLVLY
QLCVEDPMAT		VVEVRSKPKS		KWRPQALDTV		ELEKLASRKL		RINAKETMRI
AEKLYTQGYI		SYPRTETNIF		PRDLNLTVLV		EQQTPDPRWG		AFAQSILERG
GPTPRNGNKS		DQAHPPIHPT		KYTNNLQGDE		QRLYEFIVRH		FLACCSQDAQ
GQETTVEIDI		AQERFVAHGL		MILARNYLDV		YPYDHWSDKI		LPVYEQGSHF
QPSTVEMVDG		ETSPPKLLTE		ADLIALMEKH		GIGTDATHAE		HIETIKARMY
VGLTPDKRFL		PGHLGMGLVE		GYDSMGYEMS		KPDLRAELEA		DLKLICDGKK
DKFVVLRQQV		QKYKQVFIEA		VAKAKKLDEA		LAQYFGNGTE		LAQQEDIYPA
MPEPIRKCPQ		CNKDMVLKTK		KNGGFYLSCM		GFPECRSAVW		LPDSVLEASR
DSSVCPVCQP		HPVYRLKLKF		KRGSLPPTMP		LEFVCCIGGC		DDTLREILDL
RFSGGPPRAS		QPSGRLQANQ		SLNRMDNSQH		PQPADSRQTG		SSKALAQTLP
PPTAAGESNS		VTCNCGQEAV		LLTVRKEGPN		RGRQFFKCNG		GSCNFFLWAD
SPNPGAGGPP		ALAYRPLGAS		LGCPPGPGIH		LGGFGNPGDG		SGSGTSCLCS
QPSVTRTVQK		DGPNKGRQFH		TCAKPREQQC		GFFQWVDENT		APGTSGAPSW
TGDRGRTLES		EARSKRPRAS		SSDMGSTAKK		PRKCSLCHQP		GHTRPFCPQN
R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, топоізомераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, іоном магнію.

Література

• Hanai R., Caron P.R., Wang J.C. (1996). Human TOP3: a single-copy gene encoding DNA topoisomerase III. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 3653—3657. PMID 8622991 DOI:10.1073/pnas.93.8.3653
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yang J., Bachrati C.Z., Ou J., Hickson I.D., Brown G.W. (2010). Human topoisomerase IIIalpha is a single-stranded DNA decatenase that is stimulated by BLM and RMI1. J. Biol. Chem. 285: 21426—21436. PMID 20445207 DOI:10.1074/jbc.M110.123216

Див. також

• Хромосома 17