TARBP1

TARBP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2HA8
Ідентифікатори
Символи	TARBP1, TRM3, TRP-185, TRP185, TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, TRMT3
Зовнішні ІД	OMIM: 605052 MGI: 4936930 HomoloGene: 38082 GeneCards: TARBP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity; • RNA methyltransferase activity; • transferase activity; • tRNA (guanine) methyltransferase activity; • RNA binding; • rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • Метилювання; • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing; • tRNA methylation; • enzyme-directed rRNA 2'-O-methylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6894
	212728
	ENSG00000059588
	ENSMUSG00000090290
	Q13395
	E9Q368
	NM_005646
	NM_001159907
	NP_005637
	NP_001153379
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TARBP1 (англ. TAR (HIV-1) RNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 621 амінокислот, а молекулярна маса — 181 675^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEWVLAEALL	SQSRDPRALL	GALCQGEASA	ERVETLRFLL	QRLEDEEARG
SGGAGALPEA	AREVAAGYLV	PLLRSLRGRP	AGGPDPSLQP	RHRRRVLRAA
GAALRSCVRL	AGRPQLAAAL	AEEALRDLLA	GWRAPGAEAA	VEVLAAVGPC
LRPREDGPLL	ERVAGTAVAL	ALGGGGDGDE	AGPAEDAAAL	VAGRLLPVLV
QCGGAALRAV	WGGLAAPGAS	LGSGRVEEKL	LVLSALAEKL	LPEPGGDRAR
GAREAGPDAR	RCWRFWRTVQ	AGLGQADALT	RKRARYLLQR	AVEVSAELGA
DCTCGPQEGN	GPSLFWWSER	KKDELLKFWE	NYILIMETLE	GNQIHVIKPV
LPKLNNLFEY	AVSEENGCWL	FHPSWHMCIY	KRMFESENKI	LSKEGVIHFL
ELYETKILPF	SPEFSEFIIG	PLMDALSESS	LYSRSPGQPI	GSCSPLGLKL
QKFLVTYISL	LPEEIKSSFL	LKFIRKMTSR	HWCAVPILFL	SKALANVPRH
KALGIDGLLA	LRDVIHCTMI	THQILLRGAA	QCYLLQTAMN	LLDVEKVSLS
DVSTFLMSLR	QEESLGRGTS	LWTELCDWLR	VNESYFKPSP	TCSSIGLHKT
SLNAYVKSIV	QEYVKSSAWE	TGENCFMPDW	FEAKLVSLMV	LLAVDVEGMK
TQYSGKQRTE	NVLRIFLDPL	LDVLMKFSTN	AYMPLLKTDR	CLQLLLKLLN
TCRLKGSSAQ	DDEVSTVLQN	FFMSTTESIS	EFILRRLTMN	ELNSVSDLDR
CHLYLMVLTE	LINLHLKVGW	KRGNPIWRVI	SLLKNASIQH	LQEMDSGQEP
TVGSQIQRVV	SMAALAMVCE	AIDQKPELQL	DSLHAGPLES	FLSSLQLNQT
LQKPHAEEQS	SYAHPLECSS	VLEESSSSQG	WGKIVAQYIH	DQWVCLSFLL
KKYHTLIPTT	GSEILEPFLP	AVQMPIRTLQ	SALEALTVLS	SDQVLPVFHC
LKVLVPKLLT	SSESLCIESF	DMAWKIISSL	SNTQLIFWAN	LKAFVQFVFD
NKVLTIAAKI	KGQAYFKIKE	IMYKIIEMSA	IKTGVFNTLI	SYCCQSWIVS
ASNVSQGSLS	SAKNYSELIL	EACIFGTVFR	RDQRLVQDVQ	TFIENLGHDC
AANIVMENTK	REDHYVRICA	VKFLCLLDGS	NMSHKLFIED	LAIKLLDKDE
LVSKSKKRYY	VNSLQHRVKN	RVWQTLLVLF	PRLDQNFLNG	IIDRIFQAGF
TNNQASIKYF	IEWIIILILH	KFPQFLPKFW	DCFSYGEENL	KTSICTFLAV
LSHLDIITQN	IPEKKLILKQ	ALIVVLQWCF	NHNFSVRLYA	LVALKKLWTV
CKVLSVEEFD	ALTPVIESSL	HQVESMHGAG	NAKKNWQRIQ	EHFFFATFHP
LKDYCLETIF	YILPRLSGLI	EDEWITIDKF	TRFTDVPLAA	GFQWYLSQTQ
LSKLKPGDWS	QQDIGTNLVE	ADNQAEWTDV	QKKIIPWNSR	VSDLDLELLF
QDRAARLGKS	ISRLIVVASL	IDKPTNLGGL	CRTCEVFGAS	VLVVGSLQCI
SDKQFQHLSV	SAEQWLPLVE	VKPPQLIDYL	QQKKTEGYTI	IGVEQTAKSL
DLTQYCFPEK	SLLLLGNERE	GIPANLIQQL	DVCVEIPQQG	IIRSLNVHVS
GALLIWEYTR	QQLLSHGDTK	P

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК, s-аденозил-l-метіоніном.

Література ред.

Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor R.B. (1995). Specific binding of RNA polymerase II to the human immunodeficiency virus trans-activating region RNA is regulated by cellular cofactors and Tat. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 7153—7157. PMID 7638159 DOI:10.1073/pnas.92.16.7153
Wu-Baer F., Lane W.S., Gaynor R.B. (1996). Identification of a group of cellular cofactors that stimulate the binding of RNA polymerase II and TRP-185 to human immunodeficiency virus 1 TAR RNA. J. Biol. Chem. 271: 4201—4208. PMID 8626763 DOI:10.1074/jbc.271.8.4201
Wu H., Min J., Zeng H., Plotnikov A.N. (2008). Crystal structure of the methyltransferase domain of human TARBP1. Proteins. 72: 519—525. PMID 18412263 DOI:10.1002/prot.22065
Wu-Baer F., Lane W.S., Gaynor R.B. (1995). The cellular factor TRP-185 regulates RNA polymerase II binding to HIV-1 TAR RNA. EMBO J. 14: 5995—6009. PMID 8846792

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11568 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
↑ UniProt, Q13395 (англ.) . Архів оригіналу за 4 грудня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також ред.

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11568 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q13395 (англ.) . Архів оригіналу за 4 грудня 2016. Процитовано 25 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]