TAF1D

TAF1D (англ. TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 278 амінокислот, а молекулярна маса — 32 058.

TAF1D
Ідентифікатори
Символи	TAF1D, JOSD3, RAFI41, TAF(I)41, TAFI41, TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit D
Зовнішні ІД	OMIM: 612823 MGI: 1922566 HomoloGene: 11472 GeneCards: TAF1D
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • RNA polymerase transcription factor SL1 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок Біологічний процес • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • termination of RNA polymerase I transcription • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79101	75316
Ensembl	ENSG00000166012	ENSMUSG00000031939
UniProt	Q9H5J8	Q9D4V4
RefSeq (мРНК)	NM_024116	NM_026541 NM_027261 NM_029248
RefSeq (білок)	NP_077021	NP_081537 NP_083524
Локус (UCSC)	Хр. 11: 93.73 – 93.78 Mb	Хр. 9: 15.31 – 15.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDKSGIDSLD		HVTSDAVELA		NRSDNSSDSS		LFKTQCIPYS		PKGEKRNPIR
KFVRTPESVH		ASDSSSDSSF		EPIPLTIKAI		FERFKNRKKR		YKKKKKRRYQ
PTGRPRGRPE		GRRNPIYSLI		DKKKQFRSRG		SGFPFLESEN		EKNAPWRKIL
TFEQAVARGF		FNYIEKLKYE		HHLKESLKQM		NVGEDLENED		FDSRRYKFLD
DDGSISPIEE		STAEDEDATH		LEDNECDIKL		AGDSFIVSSE		FPVRLSVYLE
EEDITEEAAL		SKKRATKAKN		TGQRGLKM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Wang L., Bhattacharyya N., Chelsea D.M., Escobar P.F., Banerjee S. (2004). A novel nuclear protein, MGC5306 interacts with DNA polymerase beta and has a potential role in cellular phenotype. Cancer Res. 64: 7673—7677. PMID 15520167 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-04-2801
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Friedrich J.K., Panov K.I., Cabart P., Russell J., Zomerdijk J.C.B.M. (2005). TBP-TAF complex SL1 directs RNA polymerase I pre-initiation complex formation and stabilizes upstream binding factor at the rDNA promoter. J. Biol. Chem. 280: 29551—29558. PMID 15970593 DOI:10.1074/jbc.M501595200

Див. також

• Хромосома 11