TAF1C

TAF1C
Ідентифікатори
Символи	TAF1C, MGC:39976, SL1, TAFI110, TAFI95, TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit C
Зовнішні ІД	OMIM: 604905 MGI: 109576 HomoloGene: 21163 GeneCards: TAF1C
Пов'язані генетичні захворювання
	аутизм
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001187 RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• RNA polymerase I transcription regulator complex; • fibrillar center; • нуклеоплазма; • ядерце; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• termination of RNA polymerase I transcription; • transcription initiation from RNA polymerase I promoter; • epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation; • transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • regulation of transcription by RNA polymerase I; • RNA polymerase I preinitiation complex assembly; • transcription by RNA polymerase I; • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	9013
	21341
	ENSG00000103168
	ENSMUSG00000031832
	Q15572
	Q6PDZ2
NM_001243156; NM_001243157; NM_001243158; NM_001243159; NM_001243160;
	NM_005679; NM_139353
	NM_021441; NM_001378901
NP_001230085; NP_001230086; NP_001230087; NP_001230088; NP_001230089;
	NP_005670; NP_647610
	NP_067416; NP_001365830
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TAF1C (англ. TATA-box binding protein associated factor, RNA polymerase I subunit C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 869 амінокислот, а молекулярна маса — 95 213^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDFPSSLRPA	LFLTGPLGLS	DVPDLSFMCS	WRDALTLPEA	QPQNSENGAL
HVTKDLLWEP	ATPGPLPMLP	PLIDPWDPGL	TARDLLFRGG	CRYRKRPRVV
LDVTEQISRF	LLDHGDVAFA	PLGKLMLENF	KLEGAGSRTK	KKTVVSVKKL
LQDLGGHQPW	GCPWAYLSNR	QRRFSILGGP	ILGTSVASHL	AELLHEELVL
RWEQLLLDEA	CTGGALAWVP	GRTPQFGQLV	YPAGGAQDRL	HFQEVVLTPG
DNPQFLGKPG	RIQLQGPVRQ	VVTCTVQGES	KALIYTFLPH	WLTCYLTPGP
FHPSSALLAV	RSDYHCAVWK	FGKQWQPTLL	QAMQVEKGAT	GISLSPHLPG
ELAICSRSGA	VCLWSPEDGL	RQIYRDPETL	VFRDSSSWRW	ADFTAHPRVL
TVGDRTGVKM	LDTQGPPGCG	LLLFRLGAEA	SCQKGERVLL	TQYLGHSSPK
CLPPTLHLVC	TQFSLYLVDE	RLPLVPMLKW	NHGLPSPLLL	ARLLPPPRPS
CVQPLLLGGQ	GGQLQLLHLA	GEGASVPRLA	GPPQSLPSRI	DSLPAFPLLE
PKIQWRLQER	LKAPTIGLAA	VVPPLPSAPT	PGLVLFQLSA	AGDVFYQQLR
PQVDSSLRRD	AGPPGDTQPD	CHAPTASWTS	QDTAGCSQWL	KALLKVPLAP
PVWTAPTFTH	RQMLGSTELR	REEEEGQRLG	VLRKAMARGQ	LLLQRDLGSL
PAAEPPPAPE	SGLEDKLSER	LGEAWAGRGA	AWWERQQGRT	SEPGRQTRRP
KRRTQLSSSF	SLSGHVDPSE	DTSSPHSPEW	PPADALPLPP	TTPPSQELTP
DACAQGVPSE	QRQMLRDYMA	KLPPQRDTPG	CATTPPHSQA	SSVRATRSQQ
HTPVLSSSQP	LRKKPRMGF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhai W., Comai L. (2000). Repression of RNA polymerase I transcription by the tumor suppressor p53. Mol. Cell. Biol. 20: 5930—5938. PMID 10913176 DOI:10.1128/MCB.20.16.5930-5938.2000
Friedrich J.K., Panov K.I., Cabart P., Russell J., Zomerdijk J.C.B.M. (2005). TBP-TAF complex SL1 directs RNA polymerase I pre-initiation complex formation and stabilizes upstream binding factor at the rDNA promoter. J. Biol. Chem. 280: 29551—29558. PMID 15970593 DOI:10.1074/jbc.M501595200