SUPV3L1

SUPV3L1 (англ. Suv3 like RNA helicase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 786 амінокислот, а молекулярна маса — 87 991.

SUPV3L1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3RC3, 3RC8
Ідентифікатори
Символи	SUPV3L1, SUV3, Suv3 like RNA helicase
Зовнішні ІД	OMIM: 605122 MGI: 2441711 HomoloGene: 2386 GeneCards: SUPV3L1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • protein homodimerization activity • GO:0008026 helicase activity • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity • hydrolase activity, acting on acid anhydrides • GO:0004003 DNA helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • double-stranded RNA binding • ATP binding • hydrolase activity • RNA binding Клітинна компонента • mitochondrial degradosome • мітохондріальний матрикс • мітохондрія • mitochondrial nucleoid • клітинне ядро Біологічний процес • DNA recombination • mitochondrial mRNA catabolic process • mitochondrial ncRNA surveillance • mitochondrial RNA 3'-end processing • Деградація РНК • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of cell growth • DNA duplex unwinding • mitochondrial mRNA surveillance • mitochondrion morphogenesis • mitochondrial RNA surveillance • positive regulation of mitochondrial RNA catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6832	338359
Ensembl	ENSG00000156502	ENSMUSG00000020079
UniProt	Q8IYB8	Q80YD1
RefSeq (мРНК)	NM_001301683 NM_003171 NM_001323584 NM_001323585 NM_001323586 NM_001323587 NM_001323588	NM_181423 NM_001359806
RefSeq (білок)	NP_001288612 NP_001310513 NP_001310514 NP_001310515 NP_001310516 NP_001310517 NP_003162	NP_852088 NP_001346735
Локус (UCSC)	Хр. 10: 69.18 – 69.21 Mb	Хр. 10: 62.26 – 62.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSFSRALLWA		RLPAGRQAGH		RAAICSALRP		HFGPFPGVLG		QVSVLATASS
SASGGSKIPN		TSLFVPLTVK		PQGPSADGDV		GAELTRPLDK		NEVKKVLDKF
YKRKEIQKLG		ADYGLDARLF		HQAFISFRNY		IMQSHSLDVD		IHIVLNDICF
GAAHADDLFP		FFLRHAKQIF		PVLDCKDDLR		KISDLRIPPN		WYPDARAMQR
KIIFHSGPTN		SGKTYHAIQK		YFSAKSGVYC		GPLKLLAHEI		FEKSNAAGVP
CDLVTGEERV		TVQPNGKQAS		HVSCTVEMCS		VTTPYEVAVI		DEIQMIRDPA
RGWAWTRALL		GLCAEEVHLC		GEPAAIDLVM		ELMYTTGEEV		EVRDYKRLTP
ISVLDHALES		LDNLRPGDCI		VCFSKNDIYS		VSRQIEIRGL		ESAVIYGSLP
PGTKLAQAKK		FNDPNDPCKI		LVATDAIGMG		LNLSIRRIIF		YSLIKPSINE
KGERELEPIT		TSQALQIAGR		AGRFSSRFKE		GEVTTMNHED		LSLLKEILKR
PVDPIRAAGL		HPTAEQIEMF		AYHLPDATLS		NLIDIFVDFS		QVDGQYFVCN
MDDFKFSAEL		IQHIPLSLRV		RYVFCTAPIN		KKQPFVCSSL		LQFARQYSRN
EPLTFAWLRR		YIKWPLLPPK		NIKDLMDLEA		VHDVLDLYLW		LSYRFMDMFP
DASLIRDLQK		ELDGIIQDGV		HNITKLIKMS		ETHKLLNLEG		FPSGSQSRLS
GTLKSQARRT		RGTKALGSKA		TEPPSPDAGE		LSLASRLVQQ		GLLTPDMLKQ
LEKEWMTQQT		EHNKEKTESG		THPKGTRRKK		KEPDSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі, мітохондрії, мітохондріальному нуклеоїді.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shu Z., Vijayakumar S., Chen C.-F., Chen P.-L., Lee W.-H. (2004). Purified human SUV3p exhibits multiple-substrate unwinding activity upon conformational change. Biochemistry. 43: 4781—4790. PMID 15096047 DOI:10.1021/bi0356449
• Minczuk M., Mroczek S., Pawlak S.D., Stepien P.P. (2005). Human ATP-dependent RNA/DNA helicase hSuv3p interacts with the cofactor of survivin HBXIP. FEBS J. 272: 5008—5019. PMID 16176273 DOI:10.1111/j.1742-4658.2005.04910.x
• Bogenhagen D.F., Rousseau D., Burke S. (2008). The layered structure of human mitochondrial DNA nucleoids. J. Biol. Chem. 283: 3665—3675. PMID 18063578 DOI:10.1074/jbc.M708444200
• Wang D.D., Shu Z., Lieser S.A., Chen P.L., Lee W.H. (2009). Human mitochondrial SUV3 and polynucleotide phosphorylase form a 330-kDa heteropentamer to cooperatively degrade double-stranded RNA with a 3'-to-5' directionality. J. Biol. Chem. 284: 20812—20821. PMID 19509288 DOI:10.1074/jbc.M109.009605

Див. також

• Хромосома 10