SP8

SP8 (англ. Sp8 transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 490 амінокислот, а молекулярна маса — 48 674.

SP8
Ідентифікатори
Символи	SP8, BTD, Sp8 transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 608306 MGI: 2443471 HomoloGene: 18548 GeneCards: SP8
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • proximal/distal pattern formation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • dorsal/ventral pattern formation • embryonic limb morphogenesis • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	221833	320145
Ensembl	ENSG00000164651	ENSMUSG00000048562
UniProt	Q8IXZ3	Q8BMJ8
RefSeq (мРНК)	NM_182700 NM_198956	NM_177082 NM_001379379 NM_001379380
RefSeq (білок)	NP_874359 NP_945194	NP_796056 NP_001366308 NP_001366309
Локус (UCSC)	Хр. 7: 20.78 – 20.79 Mb	Хр. 12: 118.81 – 118.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLAATCNKIG		SPSPSPSSLS		DSSSSFGKGF		HPWKRSSSSS		SASCNVVGSS
LSSFGVSGAS		RNGGSSSAAA		AAAAAAAAAA		ALVSDSFSCG		GSPGSSAFSL
TSSSAAAAAA		AAAAAASSSP		FANDYSVFQA		PGVSGGSGGG		GGGGGGGSSA
HSQDGSHQPV		FISKVHTSVD		GLQGIYPRVG		MAHPYESWFK		PSHPGLGAAG
EVGSAGASSW		WDVGAGWIDV		QNPNSAAALP		GSLHPAAGGL		QTSLHSPLGG
YNSDYSGLSH		SAFSSGASSH		LLSPAGQHLM		DGFKPVLPGS		YPDSAPSPLA
GAGGSMLSAG		PSAPLGGSPR		SSARRYSGRA		TCDCPNCQEA		ERLGPAGASL
RRKGLHSCHI		PGCGKVYGKT		SHLKAHLRWH		TGERPFVCNW		LFCGKRFTRS
DELQRHLRTH		TGEKRFACPV		CNKRFMRSDH		LSKHVKTHSG		GGGGGGSAGS
GSGGKKGSDT		DSEHSAAGSP		PCHSPELLQP		PEPGHRNGLE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Milona M.-A., Gough J.E., Edgar A.J. (2004). Genomic structure and cloning of two transcript isoforms of human Sp8. BMC Genomics. 5: 86—86. PMID 15533246 DOI:10.1186/1471-2164-5-86
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7