SP1

SP1 (англ. Sp1 transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 785 амінокислот, а молекулярна маса — 80 693.

SP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1SP1, 1SP2, 1VA1, 1VA2, 1VA3
Ідентифікатори
Символи	SP1, entrez:6667, Sp1 transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 189906 MGI: 98372 HomoloGene: 8276 GeneCards: SP1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • HMG box domain binding • transcription factor binding • histone deacetylase binding • зв'язування з іоном металу • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • bHLH transcription factor binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • nucleic acid binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • double-stranded DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • protein-DNA complex • клітинне ядро • transcription repressor complex Біологічний процес • positive regulation of hydrogen sulfide biosynthetic process • ритмічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0022415 viral process • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II • cellular response to insulin stimulus • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cholesterol biosynthetic process • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of vascular endothelial cell proliferation • response to hydroperoxide Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6667	20683
Ensembl	ENSG00000185591	ENSMUSG00000001280
UniProt	P08047	O89090
RefSeq (мРНК)	NM_001251825 NM_003109 NM_138473	NM_013672
RefSeq (білок)	NP_001238754 NP_003100 NP_612482	NP_038700
Локус (UCSC)	Хр. 12: 53.38 – 53.42 Mb	Хр. 15: 102.31 – 102.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDQDHSMDE		MTAVVKIEKG		VGGNNGGNGN		GGGAFSQARS		SSTGSSSSTG
GGGQESQPSP		LALLAATCSR		IESPNENSNN		SQGPSQSGGT		GELDLTATQL
SQGANGWQII		SSSSGATPTS		KEQSGSSTNG		SNGSESSKNR		TVSGGQYVVA
AAPNLQNQQV		LTGLPGVMPN		IQYQVIPQFQ		TVDGQQLQFA		ATGAQVQQDG
SGQIQIIPGA		NQQIITNRGS		GGNIIAAMPN		LLQQAVPLQG		LANNVLSGQT
QYVTNVPVAL		NGNITLLPVN		SVSAATLTPS		SQAVTISSSG		SQESGSQPVT
SGTTISSASL		VSSQASSSSF		FTNANSYSTT		TTTSNMGIMN		FTTSGSSGTN
SQGQTPQRVS		GLQGSDALNI		QQNQTSGGSL		QAGQQKEGEQ		NQQTQQQQIL
IQPQLVQGGQ		ALQALQAAPL		SGQTFTTQAI		SQETLQNLQL		QAVPNSGPII
IRTPTVGPNG		QVSWQTLQLQ		NLQVQNPQAQ		TITLAPMQGV		SLGQTSSSNT
TLTPIASAAS		IPAGTVTVNA		AQLSSMPGLQ		TINLSALGTS		GIQVHPIQGL
PLAIANAPGD		HGAQLGLHGA		GGDGIHDDTA		GGEEGENSPD		AQPQAGRRTR
REACTCPYCK		DSEGRGSGDP		GKKKQHICHI		QGCGKVYGKT		SHLRAHLRWH
TGERPFMCTW		SYCGKRFTRS		DELQRHKRTH		TGEKKFACPE		CPKRFMRSDH
LSKHIKTHQN		KKGGPGVALS		VGTLPLDSGA		GSEGSGTATP		SALITTNMVA
MEAICPEGIA		RLANSGINVM		QVADLQSINI		SGNGF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takahara T., Kanazu S., Yanagisawa S., Akanuma H. (2000). Heterogeneous Sp1 mRNAs in human HepG2 cells include a product of homotypic trans-splicing. J. Biol. Chem. 275: 38067—38072. PMID 10973950 DOI:10.1074/jbc.M002010200
• Kadonaga J.T., Carner K.R., Masiarz F.R., Tjian R. (1987). Isolation of cDNA encoding transcription factor Sp1 and functional analysis of the DNA binding domain. Cell. 51: 1079—1090. PMID 3319186 DOI:10.1016/0092-8674(87)90594-0
• Jackson S.P., Tjian R. (1988). O-glycosylation of eukaryotic transcription factors: implications for mechanisms of transcriptional regulation. Cell. 55: 125—133. PMID 3139301 DOI:10.1016/0092-8674(88)90015-3
• Courey A.J., Tjian R. (1988). Analysis of Sp1 in vivo reveals multiple transcriptional domains, including a novel glutamine-rich activation motif. Cell. 55: 887—898. PMID 3142690 DOI:10.1016/0092-8674(88)90144-4
• Wang L., Mukherjee S., Jia F., Narayan O., Zhao L.J. (1995). Interaction of virion protein Vpr of human immunodeficiency virus type 1 with cellular transcription factor Sp1 and trans-activation of viral long terminal repeat. J. Biol. Chem. 270: 25564—25569. PMID 7592727 DOI:10.1074/jbc.270.43.25564

Див. також

• Хромосома 12