SOX21

SOX21 (англ. SRY-box 21) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 276 амінокислот, а молекулярна маса — 28 580.

SOX21
Ідентифікатори
Символи	SOX21, SOX25, SRY-box 21, SRY-box transcription factor 21
Зовнішні ІД	OMIM: 604974 MGI: 2654070 HomoloGene: 5143 GeneCards: SOX21
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • компонент клітини Біологічний процес • hair follicle development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • hair cycle • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • stem cell differentiation • skin development • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Диференціація клітин • central nervous system development • neuron differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11166	223227
Ensembl	ENSG00000125285	ENSMUSG00000061517
UniProt	Q9Y651	Q811W0
RefSeq (мРНК)	NM_007084	NM_177753
RefSeq (білок)	NP_009015	NP_808421
Локус (UCSC)	Хр. 13: 94.71 – 94.71 Mb	Хр. 14: 118.47 – 118.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKPVDHVKR		PMNAFMVWSR		AQRRKMAQEN		PKMHNSEISK		RLGAEWKLLT
ESEKRPFIDE		AKRLRAMHMK		EHPDYKYRPR		RKPKTLLKKD		KFAFPVPYGL
GGVADAEHPA		LKAGAGLHAG		AGGGLVPESL		LANPEKAAAA		AAAAAARVFF
PQSAAAAAAA		AAAAAAGSPY		SLLDLGSKMA		EISSSSSGLP		YASSLGYPTA
GAGAFHGAAA		AAAAAAAAAG		GHTHSHPSPG		NPGYMIPCNC		SAWPSPGLQP
PLAYILLPGM		GKPQLDPYPA		AYAAAL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Malas S., Duthie S., Deloukas P., Episkopou V. (1999). The isolation and high-resolution chromosomal mapping of human SOX14 and SOX21; two members of the SOX gene family related to SOX1, SOX2, and SOX3.. Mamm. Genome 10: 934 — 937.  PubMed DOI:10.1007/s003359901118

Див. також

• Хромосома 13