SIX6

SIX6 (англ. SIX homeobox 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 246 амінокислот, а молекулярна маса — 27 687.

SIX6
Ідентифікатори
Символи	SIX6, MCOPCT2, OPTX2, Six9, ODRMD, SIX homeobox 6
Зовнішні ІД	OMIM: 606326 MGI: 1341840 HomoloGene: 7220 GeneCards: SIX6
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • sequence-specific double-stranded DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • transcription regulator complex Біологічний процес • розвиток ока • animal organ morphogenesis • multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • зір • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:1903374 anatomical structure development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4990	20476
Ensembl	ENSG00000184302	ENSMUSG00000021099
UniProt	O95475	Q9QZ28
RefSeq (мРНК)	NM_007374	NM_011384
RefSeq (білок)	NP_031400	NP_035514
Локус (UCSC)	Хр. 14: 60.51 – 60.51 Mb	Хр. 12: 72.99 – 72.99 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFQLPILNFS		PQQVAGVCET		LEESGDVERL		GRFLWSLPVA		PAACEALNKN
ESVLRARAIV		AFHGGNYREL		YHILENHKFT		KESHAKLQAL		WLEAHYQEAE
KLRGRPLGPV		DKYRVRKKFP		LPRTIWDGEQ		KTHCFKERTR		HLLREWYLQD
PYPNPSKKRE		LAQATGLTPT		QVGNWFKNRR		QRDRAAAAKN		RLQQQVLSQG
SGRALRAEGD		GTPEVLGVAT		SPAASLSSKA		ATSAISITSS		DSECDI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Lopez-Rios J., Gallardo E., Rodriguez de Cordoba S., Bovolenta P. (1999). Six9 (Optx2), a new member of the Six gene family of transcription factors, is expressed at early stages of vertebrate ocular and pituitary development. Mech. Dev. 83: 155—159. PMID 10381575 DOI:10.1016/S0925-4773(99)00017-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kitano T., Liu Y.-H., Ueda S., Saitou N. (2004). Human-specific amino acid changes found in 103 protein-coding genes. Mol. Biol. Evol. 21: 936—944. PMID 15014171 DOI:10.1093/molbev/msh100
• Aldahmesh M.A., Khan A.O., Hijazi H., Alkuraya F.S. (2013). Homozygous truncation of SIX6 causes complex microphthalmia in humans. Clin. Genet. 84: 198—199. PMID 23167593 DOI:10.1111/cge.12046

Див. також

• Хромосома 14