SETDB2

SETDB2 (англ. SET domain bifurcated 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 719 амінокислот, а молекулярна маса — 81 894.

SETDB2
Ідентифікатори
Символи	SETDB2, C13orf4, CLLD8, CLLL8, KMT1F, SET domain bifurcated 2, SET domain bifurcated histone lysine methyltransferase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607865 MGI: 2685139 HomoloGene: 12903 GeneCards: SETDB2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • DNA binding • histone methyltransferase activity (H3-K9 specific) • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone-lysine N-methyltransferase activity Клітинна компонента • хромосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • chromosome segregation • поділ клітини • multicellular organism development • heart looping • Метилювання • histone H3-K9 methylation • histone lysine methylation • клітинний цикл • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • left/right axis specification • GO:0007067 мітоз • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	83852	239122
Ensembl	ENSG00000136169	ENSMUSG00000071350
UniProt	Q96T68	B2RXP3
RefSeq (мРНК)	NM_001160308 NM_031915 NM_001320699	NM_001081024 NM_001320720 NM_001320721
RefSeq (білок)	NP_001153780 NP_001307628 NP_114121	NP_001307649 NP_001307650
Локус (UCSC)	Хр. 13: 49.44 – 49.5 Mb	Хр. 14: 59.64 – 59.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGEKNGDAKT		FWMELEDDGK		VDFIFEQVQN		VLQSLKQKIK		DGSATNKEYI
QAMILVNEAT		IINSSTSIKG		ASQKEVNAQS		SDPMPVTQKE		QENKSNAFPS
TSCENSFPED		CTFLTTENKE		ILSLEDKVVD		FREKDSSSNL		SYQSHDCSGA
CLMKMPLNLK		GENPLQLPIK		CHFQRRHAKT		NSHSSALHVS		YKTPCGRSLR
NVEEVFRYLL		ETECNFLFTD		NFSFNTYVQL		ARNYPKQKEV		VSDVDISNGV
ESVPISFCNE		IDSRKLPQFK		YRKTVWPRAY		NLTNFSSMFT		DSCDCSEGCI
DITKCACLQL		TARNAKTSPL		SSDKITTGYK		YKRLQRQIPT		GIYECSLLCK
CNRQLCQNRV		VQHGPQVRLQ		VFKTEQKGWG		VRCLDDIDRG		TFVCIYSGRL
LSRANTEKSY		GIDENGRDEN		TMKNIFSKKR		KLEVACSDCE		VEVLPLGLET
HPRTAKTEKC		PPKFSNNPKE		LTVETKYDNI		SRIQYHSVIR		DPESKTAIFQ
HNGKKMEFVS		SESVTPEDND		GFKPPREHLN		SKTKGAQKDS		SSNHVDEFED
NLLIESDVID		ITKYREETPP		RSRCNQATTL		DNQNIKKAIE		VQIQKPQEGR
STACQRQQVF		CDEELLSETK		NTSSDSLTKF		NKGNVFLLDA		TKEGNVGRFL
NHSCCPNLLV		QNVFVETHNR		NFPLVAFFTN		RYVKARTELT		WDYGYEAGTV
PEKEIFCQCG		VNKCRKKIL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, білків розвитку, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13