SETD6

SETD6 (англ. SET domain containing 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 473 амінокислот, а молекулярна маса — 53 189.

SETD6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QXY, 3RC0
Ідентифікатори
Символи	SETD6, SET domain containing 6, SET domain containing 6, protein lysine methyltransferase
Зовнішні ІД	OMIM: 616424 MGI: 1913333 HomoloGene: 38743 GeneCards: SETD6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • NF-kappaB binding • protein-lysine N-methyltransferase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • stem cell population maintenance • histone lysine methylation • Метилювання • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • peptidyl-lysine monomethylation • stem cell differentiation • regulation of inflammatory response Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79918	66083
Ensembl	ENSG00000103037	ENSMUSG00000031671
UniProt	Q8TBK2	Q9CWY3
RefSeq (мРНК)	NM_001160305 NM_024860	NM_001035123
RefSeq (білок)	NP_001153777 NP_079136	NP_001030295 NP_001355283
Локус (UCSC)	Хр. 16: 58.52 – 58.52 Mb	Хр. 8: 95.72 – 95.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATQAKRPRV		AGPVDGGDLD		PVACFLSWCR		RVGLELSPKV		SERAGGRRTR
GGARAALTSP		PAQVAVSRQG		TVAGYGMVAR		ESVQAGELLF		VVPRAALLSQ
HTCSIGGLLE		RERVALQSQS		GWVPLLLALL		HELQAPASRW		RPYFALWPEL
GRLEHPMFWP		EEERRCLLQG		TGVPEAVEKD		LANIRSEYQS		IVLPFMEAHP
DLFSLRVRSL		ELYHQLVALV		MAYSFQEPLE		EEEDEKEPNS		PVMVPAADIL
NHLANHNANL		EYSANCLRMV		ATQPIPKGHE		IFNTYGQMAN		WQLIHMYGFV
EPYPDNTDDT		ADIQMVTVRE		AALQGTKTEA		ERHLVYERWD		FLCKLEMVGE
EGAFVIGREE		VLTEEELTTT		LKVLCMPAEE		FRELKDQDGG		GDDKREEGSL
TITNIPKLKA		SWRQLLQNSV		LLTLQTYATD		LKTDQGLLSN		KEVYAKLSWR
EQQALQVRYG		QKMILHQLLE		LTS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16