SETD3

SETD3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3SMT
Ідентифікатори
Символи	SETD3, C14orf154, SET domain containing 3, SET domain containing 3, actin histidine methyltransferase, hSETD3
Зовнішні ІД	OMIM: 615671 MGI: 1289184 HomoloGene: 41748 GeneCards: SETD3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity; • transferase activity; • histone methyltransferase activity (H3-K4 specific); • histone-lysine N-methyltransferase activity; • histone methyltransferase activity (H3-K36 specific); • GO:0001105 transcription coactivator activity; • protein-lysine N-methyltransferase activity;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of muscle cell differentiation; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • peptidyl-lysine methylation; • Метилювання; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • peptidyl-lysine dimethylation; • peptidyl-lysine trimethylation; • histone H3-K36 methylation; • peptidyl-lysine monomethylation; • histone H3-K4 methylation; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	84193
	52690
	ENSG00000183576
	ENSMUSG00000056770
	Q86TU7
	Q91WC0
	NM_032233; NM_199123
NM_028262; NM_001364266; NM_001364267; NM_001364268; NM_001364269;
	NM_001364270
	NP_115609; NP_954574
NP_082538; NP_001351195; NP_001351196; NP_001351197; NP_001351198;
	NP_001351199
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SETD3 (англ. SET domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 67 257^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKKSRVKTQ	KSGTGATATV	SPKEILNLTS	ELLQKCSSPA	PGPGKEWEEY
VQIRTLVEKI	RKKQKGLSVT	FDGKREDYFP	DLMKWASENG	ASVEGFEMVN
FKEEGFGLRA	TRDIKAEELF	LWVPRKLLMT	VESAKNSVLG	PLYSQDRILQ
AMGNIALAFH	LLCERASPNS	FWQPYIQTLP	SEYDTPLYFE	EDEVRYLQST
QAIHDVFSQY	KNTARQYAYF	YKVIQTHPHA	NKLPLKDSFT	YEDYRWAVSS
VMTRQNQIPT	EDGSRVTLAL	IPLWDMCNHT	NGLITTGYNL	EDDRCECVAL
QDFRAGEQIY	IFYGTRSNAE	FVIHSGFFFD	NNSHDRVKIK	LGVSKSDRLY
AMKAEVLARA	GIPTSSVFAL	HFTEPPISAQ	LLAFLRVFCM	TEEELKEHLL
GDSAIDRIFT	LGNSEFPVSW	DNEVKLWTFL	EDRASLLLKT	YKTTIEEDKS
VLKNHDLSVR	AKMAIKLRLG	EKEILEKAVK	SAAVNREYYR	QQMEEKAPLP
KYEESNLGLL	ESSVGDSRLP	LVLRNLEEEA	GVQDALNIRE	AISKAKATEN
GLVNGENSIP	NGTRSENESL	NQESKRAVED	AKGSSSDSTA	GVKE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, активаторів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20493 (англ.) . Процитовано 20 вересня 2017.
↑ UniProt, Q86TU7 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2016. Процитовано 20 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20493 (англ.) . Процитовано 20 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q86TU7 (англ.) . Архів оригіналу за 7 грудня 2016. Процитовано 20 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]