SETD3

SETD3 (англ. SET domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 67 257.

SETD3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3SMT
Ідентифікатори
Символи	SETD3, C14orf154, SET domain containing 3, SET domain containing 3, actin histidine methyltransferase, hSETD3
Зовнішні ІД	OMIM: 615671 MGI: 1289184 HomoloGene: 41748 GeneCards: SETD3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • histone methyltransferase activity (H3-K4 specific) • histone-lysine N-methyltransferase activity • histone methyltransferase activity (H3-K36 specific) • GO:0001105 transcription coactivator activity • protein-lysine N-methyltransferase activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of muscle cell differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • peptidyl-lysine methylation • Метилювання • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • peptidyl-lysine dimethylation • peptidyl-lysine trimethylation • histone H3-K36 methylation • peptidyl-lysine monomethylation • histone H3-K4 methylation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84193	52690
Ensembl	ENSG00000183576	ENSMUSG00000056770
UniProt	Q86TU7	Q91WC0
RefSeq (мРНК)	NM_032233 NM_199123	NM_028262 NM_001364266 NM_001364267 NM_001364268 NM_001364269 NM_001364270
RefSeq (білок)	NP_115609 NP_954574	NP_082538 NP_001351195 NP_001351196 NP_001351197 NP_001351198 NP_001351199
Локус (UCSC)	Хр. 14: 99.4 – 99.48 Mb	Хр. 12: 108.07 – 108.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKKSRVKTQ		KSGTGATATV		SPKEILNLTS		ELLQKCSSPA		PGPGKEWEEY
VQIRTLVEKI		RKKQKGLSVT		FDGKREDYFP		DLMKWASENG		ASVEGFEMVN
FKEEGFGLRA		TRDIKAEELF		LWVPRKLLMT		VESAKNSVLG		PLYSQDRILQ
AMGNIALAFH		LLCERASPNS		FWQPYIQTLP		SEYDTPLYFE		EDEVRYLQST
QAIHDVFSQY		KNTARQYAYF		YKVIQTHPHA		NKLPLKDSFT		YEDYRWAVSS
VMTRQNQIPT		EDGSRVTLAL		IPLWDMCNHT		NGLITTGYNL		EDDRCECVAL
QDFRAGEQIY		IFYGTRSNAE		FVIHSGFFFD		NNSHDRVKIK		LGVSKSDRLY
AMKAEVLARA		GIPTSSVFAL		HFTEPPISAQ		LLAFLRVFCM		TEEELKEHLL
GDSAIDRIFT		LGNSEFPVSW		DNEVKLWTFL		EDRASLLLKT		YKTTIEEDKS
VLKNHDLSVR		AKMAIKLRLG		EKEILEKAVK		SAAVNREYYR		QQMEEKAPLP
KYEESNLGLL		ESSVGDSRLP		LVLRNLEEEA		GVQDALNIRE		AISKAKATEN
GLVNGENSIP		NGTRSENESL		NQESKRAVED		AKGSSSDSTA		GVKE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, активаторів, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 14