SERPIND1

SERPIND1 (англ. Serpin family D member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 499 амінокислот, а молекулярна маса — 57 071.

SERPIND1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1JMO, 1JMJ, 2NAT
Ідентифікатори
Символи	SERPIND1, D22S673, HC2, HCF2, HCII, HLS2, LS2, THPH10, serpin family D member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 142360 MGI: 96051 HomoloGene: 36018 GeneCards: SERPIND1
Пов'язані генетичні захворювання
heparin cofactor 2 deficiency
Онтологія гена Молекулярна функція • peptidase inhibitor activity • endopeptidase inhibitor activity • heparin binding • serine-type endopeptidase inhibitor activity Клітинна компонента • екзосома • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • extracellular region Біологічний процес • negative regulation of peptidase activity • біолюмінесценція • гемостаз • хемотаксис • зсідання крові • negative regulation of endopeptidase activity • посттрансляційна модифікація Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3053	15160
Ensembl	ENSG00000099937	ENSMUSG00000022766
UniProt	P05546	P49182
RefSeq (мРНК)	NM_000185	NM_008223 NM_001331047
RefSeq (білок)	NP_000176	NP_001317976 NP_032249
Локус (UCSC)	Хр. 22: 20.77 – 20.79 Mb	Хр. 16: 17.15 – 17.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKHSLNALLI		FLIITSAWGG		SKGPLDQLEK		GGETAQSADP		QWEQLNNKNL
SMPLLPADFH		KENTVTNDWI		PEGEEDDDYL		DLEKIFSEDD		DYIDIVDSLS
VSPTDSDVSA		GNILQLFHGK		SRIQRLNILN		AKFAFNLYRV		LKDQVNTFDN
IFIAPVGIST		AMGMISLGLK		GETHEQVHSI		LHFKDFVNAS		SKYEITTIHN
LFRKLTHRLF		RRNFGYTLRS		VNDLYIQKQF		PILLDFKTKV		REYYFAEAQI
ADFSDPAFIS		KTNNHIMKLT		KGLIKDALEN		IDPATQMMIL		NCIYFKGSWV
NKFPVEMTHN		HNFRLNEREV		VKVSMMQTKG		NFLAANDQEL		DCDILQLEYV
GGISMLIVVP		HKMSGMKTLE		AQLTPRVVER		WQKSMTNRTR		EVLLPKFKLE
KNYNLVESLK		LMGIRMLFDK		NGNMAGISDQ		RIAIDLFKHQ		GTITVNEEGT
QATTVTTVGF		MPLSTQVRFT		VDRPFLFLIY		EHRTSCLLFM		GRVANPSRS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз, світлочутливих білків. Задіяний у таких біологічних процесах як зсідання крові, гемостаз, хемотаксис, люмінесценція. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину.

Література

• Blinder M.A., Marasa J.C., Reynolds C.H., Deaven L.L., Tollefsen D.M. (1988). Heparin cofactor II: cDNA sequence, chromosome localization, restriction fragment length polymorphism, and expression in Escherichia coli. Biochemistry. 27: 752—759. PMID 2894851 DOI:10.1021/bi00402a039
• Ragg H. (1986). A new member of the plasma protease inhibitor gene family. Nucleic Acids Res. 14: 1073—1088. PMID 3003690 DOI:10.1093/nar/14.2.1073
• Inhorn R.C., Tollefsen D.M. (1986). Isolation and characterization of a partial cDNA clone for heparin cofactor II1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 137: 431—436. PMID 3755044 DOI:10.1016/0006-291X(86)91228-3
• Griffith M.J., Noyes C.M., Tyndall J.A., Church F.C. (1985). Structural evidence for leucine at the reactive site of heparin cofactor II. Biochemistry. 24: 6777—6782. PMID 3907702 DOI:10.1021/bi00345a008
• Baglin T.P., Carrell R.W., Church F.C., Esmon C.T., Huntington J.A. (2002). Crystal structures of native and thrombin-complexed heparin cofactor II reveal a multistep allosteric mechanism. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 11079—11084. PMID 12169660 DOI:10.1073/pnas.162232399
• Ragg H., Preibisch G. (1988). Structure and expression of the gene coding for the human serpin hLS2. J. Biol. Chem. 263: 12129—12134. PMID 2841345

Див. також

• Хромосома 22