SEMA5B

SEMA5B
Ідентифікатори
Символи	SEMA5B, SEMAG, SemG, semaphorin 5B
Зовнішні ІД	OMIM: 609298 MGI: 107555 HomoloGene: 8427 GeneCards: SEMA5B
Пов'язані генетичні захворювання
	рак стравоходу
Онтологія гена
Молекулярна функція	• neuropilin binding; • semaphorin receptor binding; • chemorepellent activity;
Клітинна компонента	• мембрана; • integral component of membrane; • міжклітинний простір;
Біологічний процес	• axon extension; • detection of light stimulus involved in visual perception; • neuron projection guidance; • multicellular organism development; • neuron projection extension; • диференціація клітин; • нейробіологія розвитку; • negative chemotaxis; • neural crest cell migration; • positive regulation of cell migration; • negative regulation of axon extension involved in axon guidance; • semaphorin-plexin signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	54437
	20357
	ENSG00000082684
	ENSMUSG00000052133
	Q9P283
	Q60519
	NM_001031702; NM_001256346; NM_001256347; NM_001256348; NM_018987
	NM_013661
	NP_001026872; NP_001243275; NP_001243276; NP_001243277
	NP_038689
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SEMA5B (англ. Semaphorin 5B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 151 амінокислот, а молекулярна маса — 125 913^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPCGFSPSPV	AHHLVPGPPD	TPAQQLRCGW	TVGGWLLSLV	RGLLPCLPPG
ARTAEGPIMV	LAGPLAVSLL	LPSLTLLVSH	LSSSQDVSSE	PSSEQQLCAL
SKHPTVAFED	LQPWVSNFTY	PGARDFSQLA	LDPSGNQLIV	GARNYLFRLS
LANVSLLQAT	EWASSEDTRR	SCQSKGKTEE	ECQNYVRVLI	VAGRKVFMCG
TNAFSPMCTS	RQVGNLSRTI	EKINGVARCP	YDPRHNSTAV	ISSQGELYAA
TVIDFSGRDP	AIYRSLGSGP	PLRTAQYNSK	WLNEPNFVAA	YDIGLFAYFF
LRENAVEHDC	GRTVYSRVAR	VCKNDVGGRF	LLEDTWTTFM	KARLNCSRPG
EVPFYYNELQ	SAFHLPEQDL	IYGVFTTNVN	SIAASAVCAF	NLSAISQAFN
GPFRYQENPR	AAWLPIANPI	PNFQCGTLPE	TGPNENLTER	SLQDAQRLFL
MSEAVQPVTP	EPCVTQDSVR	FSHLVVDLVQ	AKDTLYHVLY	IGTESGTILK
ALSTASRSLH	GCYLEELHVL	PPGRREPLRS	LRILHSARAL	FVGLRDGVLR
VPLERCAAYR	SQGACLGARD	PYCGWDGKQQ	RCSTLEDSSN	MSLWTQNITA
CPVRNVTRDG	GFGPWSPWQP	CEHLDGDNSG	SCLCRARSCD	SPRPRCGGLD
CLGPAIHIAN	CSRNGAWTPW	SSWALCSTSC	GIGFQVRQRS	CSNPAPRHGG
RICVGKSREE	RFCNENTPCP	VPIFWASWGS	WSKCSSNCGG	GMQSRRRACE
NGNSCLGCGV	EFKTCNPEGC	PEVRRNTPWT	PWLPVNVTQG	GARQEQRFRF
TCRAPLADPH	GLQFGRRRTE	TRTCPADGSG	SCDTDALVEV	LLRSGSTSPH
TVSGGWAAWG	PWSSCSRDCE	LGFRVRKRTC	TNPEPRNGGL	PCVGDAAEYQ
DCNPQACPVR	GAWSCWTSWS	PCSASCGGGH	YQRTRSCTSP	APSPGEDICL
GLHTEEALCA	TQACPEGWSP	WSEWSKCTDD	GAQSRSRHCE	ELLPGSSACA
GNSSQSRPCP	YSEIPVILPA	SSMEEATDCA	GFNLIHLVAT	GISCFLGSGL
LTLAVYLSCQ	HCQRQSQEST	LVHPATPNHL	HYKGGGTPKN	EKYTPMEFKT
LNKNNLIPDD	RANFYPLQQT	NVYTTTYYPS	PLNKHSFRPE	ASPGQRCFPN
S

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504