SCYL1

SCYL1
Ідентифікатори
Символи	SCYL1, GKLP, NKTL, NTKL, P105, TAPK, TEIF, TRAP, HT019, SCAR21, SCY1 like pseudokinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607982 MGI: 1931787 HomoloGene: 6947 GeneCards: SCYL1
Пов'язані генетичні захворювання
	acute infantile liver failure-cerebellar ataxia-peripheral sensory motor neuropathy syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • protein kinase activity; • protein tyrosine kinase activity; • ATP binding; • cadherin binding;
Клітинна компонента	• центр організації мікротрубочок; • cis-Golgi network; • комплекс Ґольджі; • COPI vesicle coat; • цитоскелет; • мембрана; • клітинне ядро; • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• protein phosphorylation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; • vesicle-mediated transport; • transcription, DNA-templated; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • GO:0015915 транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	57410
	78891
	ENSG00000142186
	ENSMUSG00000024941
	Q96KG9
	Q9EQC5
	NM_001048218; NM_020680
	NM_023912; NM_001361921; NM_001361922
	NP_001041683; NP_065731
	NP_076401; NP_001348850; NP_001348851
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SCYL1 (англ. SCY1 like pseudokinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 808 амінокислот, а молекулярна маса — 89 631^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWFFARDPVR	DFPFELIPEP	PEGGLPGPWA	LHRGRKKATG	SPVSIFVYDV
KPGAEEQTQV	AKAAFKRFKT	LRHPNILAYI	DGLETEKCLH	VVTEAVTPLG
IYLKARVEAG	GLKELEISWG	LHQIVKALSF	LVNDCSLIHN	NVCMAAVFVD
RAGEWKLGGL	DYMYSAQGNG	GGPPRKGIPE	LEQYDPPELA	DSSGRVVREK
WSADMWRLGC	LIWEVFNGPL	PRAAALRNPG	KIPKTLVPHY	CELVGANPKV
RPNPARFLQN	CRAPGGFMSN	RFVETNLFLE	EIQIKEPAEK	QKFFQELSKS
LDAFPEDFCR	HKVLPQLLTA	FEFGNAGAVV	LTPLFKVGKF	LSAEEYQQKI
IPVVVKMFSS	TDRAMRIRLL	QQMEQFIQYL	DEPTVNTQIF	PHVVHGFLDT
NPAIREQTVK	SMLLLAPKLN	EANLNVELMK	HFARLQAKDE	QGPIRCNTTV
CLGKIGSYLS	ASTRHRVLTS	AFSRATRDPF	APSRVAGVLG	FAATHNLYSM
NDCAQKILPV	LCGLTVDPEK	SVRDQAFKAI	RSFLSKLESV	SEDPTQLEEV
EKDVHAASSP	GMGGAAASWA	GWAVTGVSSL	TSKLIRSHPT	TAPTETNIPQ
RPTPEGVPAP	APTPVPATPT	TSGHWETQEE	DKDTAEDSST	ADRWDDEDWG
SLEQEAESVL	AQQDDWSTGG	QVSRASQVSN	SDHKSSKSPE	SDWSSWEAEG
SWEQGWQEPS	SQEPPPDGTR	LASEYNWGGP	ESSDKGDPFA	TLSARPSTQP
RPDSWGEDNW	EGLETDSRQV	KAELARKKRE	ERRREMEAKR	AERKVAKGPM
KLGARKLD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, апараті гольджі.

Література

Kato M., Yano K., Morotomi-Yano K., Saito H., Miki Y. (2002). Identification and characterization of the human protein kinase-like gene NTKL: mitosis-specific centrosomal localization of an alternatively spliced isoform. Genomics. 79: 760—767. PMID 12036289 DOI:10.1006/geno.2002.6774
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zhao Y., Zheng J., Ling Y., Hou L., Zhang B. (2005). Transcriptional upregulation of DNA polymerase beta by TEIF. Biochem. Biophys. Res. Commun. 333: 908—916. PMID 15963946 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.05.172