RNF138

RNF138 (англ. Ring finger protein 138) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 245 амінокислот, а молекулярна маса — 28 193.

RNF138
Ідентифікатори
Символи	RNF138, HSD-4, NARF, STRIN, hNARF, ring finger protein 138
Зовнішні ІД	OMIM: 616319 MGI: 1929211 HomoloGene: 9446 GeneCards: RNF138
Онтологія гена Молекулярна функція • single-stranded DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • ubiquitin conjugating enzyme binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity Клітинна компонента • site of double-strand break • клітинне ядро • хромосома Біологічний процес • DNA double-strand break processing involved in repair via single-strand annealing • protein polyubiquitination • Wnt signaling pathway • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • double-strand break repair via homologous recombination • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • cellular response to leukemia inhibitory factor Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51444	56515
Ensembl	ENSG00000134758	ENSMUSG00000024317
UniProt	Q8WVD3	Q9CQE0
RefSeq (мРНК)	NM_001191324 NM_016271 NM_198128	NM_019706 NM_207623 NM_001303005 NM_001303011
RefSeq (білок)	NP_001178253 NP_057355 NP_937761	NP_001289934 NP_001289940 NP_062680 NP_997506
Локус (UCSC)	Хр. 18: 32.09 – 32.13 Mb	Хр. 18: 21.13 – 21.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEDLSAATS		YTEDDFYCPV		CQEVLKTPVR		TTACQHVFCR		KCFLTAMRES
GAHCPLCRGN		VTRRERACPE		RALDLENIMR		KFSGSCRCCA		KQIKFYRMRH
HYKSCKKYQD		EYGVSSIIPN		FQISQDSVGN		SNRSETSTSD		NTETYQENTS
SSGHPTFKCP		LCQESNFTRQ		RLLDHCNSNH		LFQIVPVTCP		ICVSLPWGDP
SQITRNFVSH		LNQRHQFDYG		EFVNLQLDEE		TQYQTAVEES		FQVNI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, сигнальний шлях Wnt, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 18