RFXAP

RFXAP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2KW3
Ідентифікатори
Символи	RFXAP, regulatory factor X associated protein
Зовнішні ІД	OMIM: 601861 MGI: 2180854 HomoloGene: 452 GeneCards: RFXAP
Пов'язані генетичні захворювання
	bare lymphocyte syndrome 2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001105 transcription coactivator activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • DNA binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • nuclear speck;
Біологічний процес	• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5994
	170767
	ENSG00000133111
	ENSMUSG00000036615
	O00287
	Q8VCG9
	NM_000538
	NM_133231
	NP_000529
	NP_573494
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RFXAP (англ. Regulatory factor X associated protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 272 амінокислот, а молекулярна маса — 28 232^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAQGVAEGA	GPGAASGVPH	PAALAPAAAP	TLAPASVAAA	ASQFTLLVMQ
PCAGQDEAAA	PGGSVGAGKP	VRYLCEGAGD	GEEEAGEDEA	DLLDTSDPPG
GGESAASLED	LEDEETHSGG	EGSSGGARRR	GSGGGSMSKT	CTYEGCSETT
SQVAKQRKPW	MCKKHRNKMY	KDKYKKKKSD	QALNCGGTAS	TGSAGNVKLE
ESADNILSIV	KQRTGSFGDR	PARPTLLEQV	LNQKRLSLLR	SPEVVQFLQK
QQQLLNQQVL	EQRQQQFPGT	SM

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Laird K.M., Briggs L.L., Boss J.M., Summers M.F., Garvie C.W. (2010). Solution structure of the heterotrimeric complex between the interaction domains of RFX5 and RFXAP from the RFX gene regulatory complex. J. Mol. Biol. 403: 40—51. PMID 20732328 DOI:10.1016/j.jmb.2010.08.025