PSMC3IP

PSMC3IP (англ. PSMC3 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 217 амінокислот, а молекулярна маса — 24 906.

PSMC3IP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MH2
Ідентифікатори
Символи	PSMC3IP, GT198, HOP2, HUMGT198A, ODG3, TBPIP, PSMC3 interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 608665 MGI: 1098610 HomoloGene: 5940 GeneCards: PSMC3IP
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nuclear receptor coactivator activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • компонент клітини Біологічний процес • DNA recombination • GO:0007126 мейоз • reciprocal meiotic recombination • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29893	19183
Ensembl	ENSG00000131470	ENSMUSG00000019303
UniProt	Q9P2W1	O35047
RefSeq (мРНК)	NM_001256014 NM_001256015 NM_001256016 NM_013290 NM_016556	NM_008949
RefSeq (білок)	NP_001242943 NP_001242944 NP_001242945 NP_037422 NP_057640	NP_032975
Локус (UCSC)	Хр. 17: 42.57 – 42.58 Mb	Хр. 11: 100.98 – 100.99 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKGRAEAAA		GAAGILLRYL		QEQNRPYSSQ		DVFGNLQREH		GLGKAVVVKT
LEQLAQQGKI		KEKMYGKQKI		YFADQDQFDM		VSDADLQVLD		GKIVALTAKV
QSLQQSCRYM		EAELKELSSA		LTTPEMQKEI		QELKKECAGY		RERLKNIKAA
TNHVTPEEKE		QVYRERQKYC		KEWRKRKRMA		TELSDAILEG		YPKSKKQFFE
EVGIETDEDY		NVTLPDP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як рекомбінація ДНК, мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Ko L., Cardona G.R., Henrion-Caude A., Chin W.W. (2002). Identification and characterization of a tissue-specific coactivator, GT198, that interacts with the DNA-binding domains of nuclear receptors. Mol. Cell. Biol. 22: 357—369. PMID 11739747 DOI:10.1128/MCB.22.1.357-369.2002
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pan Q., Luo X., Chegini N. (2007). Genomic and proteomic profiling I: leiomyomas in African Americans and Caucasians. Reprod. Biol. Endocrinol. 5: 34—34. PMID 17716379 DOI:10.1186/1477-7827-5-34

Див. також

• Хромосома 17