PSIP1

PSIP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1Z9E, 2B4J, 2M16, 2MSR, 2MTN, 2N3A, 3F9K, 3HPG, 3HPH, 3U88, 3ZEH, 4FU6
Ідентифікатори
Символи	PSIP1, DFS70, LEDGF, PAIP, PSIP2, p52, p75, PC4 and SFRS1 interacting protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603620 MGI: 2142116 HomoloGene: 13242 GeneCards: PSIP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • chromatin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • supercoiled DNA binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • nuclear periphery; • нуклеоплазма; • ядерце; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • response to heat; • GO:0001306 response to oxidative stress; • transcription, DNA-templated; • establishment of integrated proviral latency; • mRNA 5'-splice site recognition; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0022415 viral process; • nuclear transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	11168
	101739
	ENSG00000164985
	ENSMUSG00000028484
	O75475
	Q99JF8
	NM_001128217; NM_021144; NM_033222; NM_001317898; NM_001317900
	NM_001290527; NM_133948; NM_001347143; NM_001355203
	NP_001121689; NP_001304827; NP_001304829; NP_066967; NP_150091
	NP_001277456; NP_001334072; NP_598709; NP_001342132
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PSIP1 (англ. PC4 and SFRS1 interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 530 амінокислот, а молекулярна маса — 60 103^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTRDFKPGDL	IFAKMKGYPH	WPARVDEVPD	GAVKPPTNKL	PIFFFGTHET
AFLGPKDIFP	YSENKEKYGK	PNKRKGFNEG	LWEIDNNPKV	KFSSQQAATK
QSNASSDVEV	EEKETSVSKE	DTDHEEKASN	EDVTKAVDIT	TPKAARRGRK
RKAEKQVETE	EAGVVTTATA	SVNLKVSPKR	GRPAATEVKI	PKPRGRPKMV
KQPCPSESDI	ITEEDKSKKK	GQEEKQPKKQ	PKKDEEGQKE	EDKPRKEPDK
KEGKKEVESK	RKNLAKTGVT	STSDSEEEGD	DQEGEKKRKG	GRNFQTAHRR
NMLKGQHEKE	AADRKRKQEE	QMETEQQNKD	EGKKPEVKKV	EKKRETSMDS
RLQRIHAEIK	NSLKIDNLDV	NRCIEALDEL	ASLQVTMQQA	QKHTEMITTL
KKIRRFKVSQ	VIMEKSTMLY	NKFKNMFLVG	EGDSVITQVL	NKSLAEQRQH
EEANKTKDQG	KKGPNKKLEK	EQTGSKTLNG	GSDAQDGNQP	QHNGESNEDS
KDNHEASTKK	KPSSEERETE	ISLKDSTLDN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Ge H., Si Y., Roeder R.G. (1998). Isolation of cDNAs encoding novel transcription coactivators p52 and p75 reveals an alternate regulatory mechanism of transcriptional activation. EMBO J. 17: 6723—6729. PMID 9822615 DOI:10.1093/emboj/17.22.6723
Singh D.P., Kimura A., Chylack L.T. Jr., Shinohara T. (2000). Lens epithelium-derived growth factor (LEDGF/p75) and p52 are derived from a single gene by alternative splicing. Gene. 242: 265—273. PMID 10721720 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00506-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Llano M., Delgado S., Vanegas M., Poeschla E.M. (2004). Lens epithelium-derived growth factor/p75 prevents proteasomal degradation of HIV-1 integrase. J. Biol. Chem. 279: 55570—55577. PMID 15475359 DOI:10.1074/jbc.M408508200
Ge H., Si Y., Wolffe A.P. (1998). A novel transcriptional coactivator, p52, functionally interacts with the essential splicing factor ASF/SF2. Mol. Cell. 2: 751—759. PMID 9885563 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80290-7
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9527 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O75475 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9527 (англ.) . Архів оригіналу за 15 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O75475 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]