POLR2A

POLR2A (англ. RNA polymerase II subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 970 амінокислот, а молекулярна маса — 217 176.

POLR2A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2GHQ, 2GHT, 2LTO, 3D9K, 3D9L, 3D9M, 3D9N, 3D9O, 3D9P, 4JXT, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Ідентифікатори
Символи	POLR2A, POLR2, POLRA, RPB1, RPBh1, RPO2, RPOL2, RpIILS, hRPB220, hsRPB1, polymerase (RNA) II subunit A, RNA polymerase II subunit A, NEDHIB
Зовнішні ІД	OMIM: 180660 MGI: 98086 HomoloGene: 721 GeneCards: POLR2A
шифр КФ	2.7.7.48
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • DNA binding • nucleotidyltransferase activity • RNA polymerase II activity • зв'язування з іоном металу • RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • RNA binding • protein C-terminus binding • promoter-specific chromatin binding Клітинна компонента • Prp19 complex • ядерце • РНК-полімераза II • клітинне ядро • Нуклеоплазма • цитоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • somatic stem cell population maintenance • DNA-templated transcription, termination • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription by RNA polymerase II • transcription, RNA-templated • positive regulation of RNA splicing • positive regulation of viral transcription • transcription-coupled nucleotide-excision repair • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • snRNA transcription by RNA polymerase II • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • transcription, DNA-templated • RNA metabolic process • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5430	20020
Ensembl	ENSG00000284832 ENSG00000181222	ENSMUSG00000005198
UniProt	P24928	P08775
RefSeq (мРНК)	NM_000937	NM_009089 NM_001291068
RefSeq (білок)	NP_000928	NP_001277997
Локус (UCSC)	Хр. 17: 7.48 – 7.51 Mb	Хр. 11: 69.62 – 69.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHGGGPPSGD		SACPLRTIKR		VQFGVLSPDE		LKRMSVTEGG		IKYPETTEGG
RPKLGGLMDP		RQGVIERTGR		CQTCAGNMTE		CPGHFGHIEL		AKPVFHVGFL
VKTMKVLRCV		CFFCSKLLVD		SNNPKIKDIL		AKSKGQPKKR		LTHVYDLCKG
KNICEGGEEM		DNKFGVEQPE		GDEDLTKEKG		HGGCGRYQPR		IRRSGLELYA
EWKHVNEDSQ		EKKILLSPER		VHEIFKRISD		EECFVLGMEP		RYARPEWMIV
TVLPVPPLSV		RPAVVMQGSA		RNQDDLTHKL		ADIVKINNQL		RRNEQNGAAA
HVIAEDVKLL		QFHVATMVDN		ELPGLPRAMQ		KSGRPLKSLK		QRLKGKEGRV
RGNLMGKRVD		FSARTVITPD		PNLSIDQVGV		PRSIAANMTF		AEIVTPFNID
RLQELVRRGN		SQYPGAKYII		RDNGDRIDLR		FHPKPSDLHL		QTGYKVERHM
CDGDIVIFNR		QPTLHKMSMM		GHRVRILPWS		TFRLNLSVTT		PYNADFDGDE
MNLHLPQSLE		TRAEIQELAM		VPRMIVTPQS		NRPVMGIVQD		TLTAVRKFTK
RDVFLERGEV		MNLLMFLSTW		DGKVPQPAIL		KPRPLWTGKQ		IFSLIIPGHI
NCIRTHSTHP		DDEDSGPYKH		ISPGDTKVVV		ENGELIMGIL		CKKSLGTSAG
SLVHISYLEM		GHDITRLFYS		NIQTVINNWL		LIEGHTIGIG		DSIADSKTYQ
DIQNTIKKAK		QDVIEVIEKA		HNNELEPTPG		NTLRQTFENQ		VNRILNDARD
KTGSSAQKSL		SEYNNFKSMV		VSGAKGSKIN		ISQVIAVVGQ		QNVEGKRIPF
GFKHRTLPHF		IKDDYGPESR		GFVENSYLAG		LTPTEFFFHA		MGGREGLIDT
AVKTAETGYI		QRRLIKSMES		VMVKYDATVR		NSINQVVQLR		YGEDGLAGES
VEFQNLATLK		PSNKAFEKKF		RFDYTNERAL		RRTLQEDLVK		DVLSNAHIQN
ELEREFERMR		EDREVLRVIF		PTGDSKVVLP		CNLLRMIWNA		QKIFHINPRL
PSDLHPIKVV		EGVKELSKKL		VIVNGDDPLS		RQAQENATLL		FNIHLRSTLC
SRRMAEEFRL		SGEAFDWLLG		EIESKFNQAI		AHPGEMVGAL		AAQSLGEPAT
QMTLNTFHYA		GVSAKNVTLG		VPRLKELINI		SKKPKTPSLT		VFLLGQSARD
AERAKDILCR		LEHTTLRKVT		ANTAIYYDPN		PQSTVVAEDQ		EWVNVYYEMP
DFDVARISPW		LLRVELDRKH		MTDRKLTMEQ		IAEKINAGFG		DDLNCIFNDD
NAEKLVLRIR		IMNSDENKMQ		EEEEVVDKMD		DDVFLRCIES		NMLTDMTLQG
IEQISKVYMH		LPQTDNKKKI		IITEDGEFKA		LQEWILETDG		VSLMRVLSEK
DVDPVRTTSN		DIVEIFTVLG		IEAVRKALER		ELYHVISFDG		SYVNYRHLAL
LCDTMTCRGH		LMAITRHGVN		RQDTGPLMKC		SFEETVDVLM		EAAAHGESDP
MKGVSENIML		GQLAPAGTGC		FDLLLDAEKC		KYGMEIPTNI		PGLGAAGPTG
MFFGSAPSPM		GGISPAMTPW		NQGATPAYGA		WSPSVGSGMT		PGAAGFSPSA
ASDASGFSPG		YSPAWSPTPG		SPGSPGPSSP		YIPSPGGAMS		PSYSPTSPAY
EPRSPGGYTP		QSPSYSPTSP		SYSPTSPSYS		PTSPNYSPTS		PSYSPTSPSY
SPTSPSYSPT		SPSYSPTSPS		YSPTSPSYSP		TSPSYSPTSP		SYSPTSPSYS
PTSPSYSPTS		PSYSPTSPSY		SPTSPSYSPT		SPSYSPTSPS		YSPTSPNYSP
TSPNYTPTSP		SYSPTSPSYS		PTSPNYTPTS		PNYSPTSPSY		SPTSPSYSPT
SPSYSPSSPR		YTPQSPTYTP		SSPSYSPSSP		SYSPASPKYT		PTSPSYSPSS
PEYTPTSPKY		SPTSPKYSPT		SPKYSPTSPT		YSPTTPKYSP		TSPTYSPTSP
VYTPTSPKYS		PTSPTYSPTS		PKYSPTSPTY		SPTSPKGSTY		SPTSPGYSPT
SPTYSLTSPA		ISPDDSDEEN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Wintzerith M., Acker J., Vicaire S., Vigneron M., Kedinger C. (1992). Complete sequence of the human RNA polymerase II largest subunit. Nucleic Acids Res. 20: 910—910. PMID 1542581 DOI:10.1093/nar/20.4.910
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
• Parada C.A., Roeder R.G. (1999). A novel RNA polymerase II-containing complex potentiates Tat-enhanced HIV-1 transcription. EMBO J. 18: 3688—3701. PMID 10393184 DOI:10.1093/emboj/18.13.3688
• Kim J.B., Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp P.A. (1999). Tat-SF1 protein associates with RAP30 and human SPT5 proteins. Mol. Cell. Biol. 19: 5960—5968. PMID 10454543 DOI:10.1128/MCB.19.9.5960
• Allen M., Friedler A., Schon O., Bycroft M. (2002). The structure of an FF domain from human HYPA/FBP11. J. Mol. Biol. 323: 411—416. PMID 12381297 DOI:10.1016/S0022-2836(02)00968-3

Див. також

• Хромосома 17