PKNOX1

PKNOX1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1X2N
Ідентифікатори
Символи	PKNOX1, PREP1, pkonx1c, PBX/knotted 1 homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602100 MGI: 1201409 HomoloGene: 3363 GeneCards: PKNOX1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • protein heterodimerization activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • transcription regulator complex; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• erythrocyte differentiation; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • camera-type eye development; • T cell differentiation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • Ангіогенез; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription by RNA polymerase II; • кровотворення;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5316
	18771
	ENSG00000160199
	ENSMUSG00000006705
	P55347; Q96I87
	O70477
	NM_001286258; NM_004571; NM_001320694; NM_197976
	NM_016670
NP_001273187; NP_001307623; NP_004562; NP_001273187.1; NP_004562.2;
	NP_001307623.1
	NP_057879
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PKNOX1 (англ. PBX/knotted 1 homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 436 амінокислот, а молекулярна маса — 47 607^[4].

Ген відіграє важливу роль в ембріональному розвитку органів, але може також пригнічувати розвиток пухлин в дорослому організмі.^[5]

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMATQTLSID	SYQDGQQMQV	VTELKTEQDP	NCSEPDAEGV	SPPPVESQTP
MDVDKQAIYR	HPLFPLLALL	FEKCEQSTQG	SEGTTSASFD	VDIENFVRKQ
EKEGKPFFCE	DPETDNLMVK	AIQVLRIHLL	ELEKVNELCK	DFCSRYIACL
KTKMNSETLL	SGEPGSPYSP	VQSQQIQSAI	TGTISPQGIV	VPASALQQGN
VAMATVAGGT	VYQPVTVVTP	QGQVVTQTLS	PGTIRIQNSQ	LQLQLNQDLS
ILHQDDGSSK	NKRGVLPKHA	TNVMRSWLFQ	HIGHPYPTED	EKKQIAAQTN
LTLLQVNNWF	INARRRILQP	MLDSSCSETP	KTKKKTAQNR	PVQRFWPDSI
ASGVAQPPPS	ELTMSEGAVV	TITTPVNMNV	DSLQSLSSDG	ATLAVQQVMM
AGQSEDESVD	STEEDAGALA	PAHISGLVLE	NSDSLQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література ред.

Ni B., Li L.Y., Yin Z.C., Zou Y.H., Li H. (2004). Molecular cloning for an alternatively splicing cDNA of human PKNOX1 gene and it's expression analysis. Yi Chuan Xue Bao. 31: 19—25. PMID 15468914

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9022 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P55347 (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ Berthelsen J, Viggiano L, Schulz H, Ferretti E, Consalez GG, Rocchi M, Blasi F (January 1998). PKNOX1, a gene encoding PREP1, a new regulator of Pbx activity, maps on human chromosome 21q22.3 and murine chromosome 17B/C. Genomics. 47 (2): 323—4. doi:10.1006/geno.1997.5086. PMID 9479508.

Див. також ред.

Хромосома 21

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9022 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P55347 (англ.) . Архів оригіналу за 13 лютого 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[pmid9479508-5] Berthelsen J, Viggiano L, Schulz H, Ferretti E, Consalez GG, Rocchi M, Blasi F (January 1998). PKNOX1, a gene encoding PREP1, a new regulator of Pbx activity, maps on human chromosome 21q22.3 and murine chromosome 17B/C. Genomics. 47 (2): 323—4. doi:10.1006/geno.1997.5086. PMID 9479508.

[3]

[4]

[1]

[2]

[5]