PHF5A

PHF5A (англ. PHD finger protein 5A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 110 амінокислот, а молекулярна маса — 12 405.

PHF5A
Ідентифікатори
Символи	PHF5A, INI, Rds3, SAP14b, SF3B7, SF3b14b, bK223H9.2, PHD finger protein 5A
Зовнішні ІД	OMIM: 617846 MGI: 2156864 HomoloGene: 7151 GeneCards: PHF5A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • RNA binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • nuclear matrix • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • U12-type spliceosomal complex • spliceosomal complex • precatalytic spliceosome • клітинне ядро • U2 snRNP • нуклеоплазма • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84844	68479
Ensembl	ENSG00000100410	ENSMUSG00000061360
UniProt	Q7RTV0	P83870
RefSeq (мРНК)	NM_032758	NM_026737
RefSeq (білок)	NP_116147	NP_081013
Локус (UCSC)	Хр. 22: 41.46 – 41.47 Mb	Хр. 15: 81.75 – 81.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKHHPDLIF		CRKQAGVAIG		RLCEKCDGKC		VICDSYVRPC		TLVRICDECN
YGSYQGRCVI		CGGPGVSDAY		YCKECTIQEK		DRDGCPKIVN		LGSSKTDLFY
ERKKYGFKKR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований ге́ном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Golas M.M., Sander B., Will C.L., Luhrmann R., Stark H. (2003). Molecular architecture of the multiprotein splicing factor SF3b. Science. 300: 980—984. PMID 12738865 DOI:10.1126/science.1084155

Див. також

• Хромосома 22