OTUD7A

OTUD7A (англ. OTU deubiquitinase 7A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 926 амінокислот, а молекулярна маса — 100 677.

OTUD7A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2L2D
Ідентифікатори
Символи	OTUD7A, C15orf16, C16ORF15, CEZANNE2, OTUD7, OTU deubiquitinase 7A
Зовнішні ІД	OMIM: 612024 MGI: 2158505 HomoloGene: 15642 GeneCards: OTUD7A
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • zinc ion binding • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • thiol-dependent deubiquitinase Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • гіалоплазма Біологічний процес • protein K63-linked deubiquitination • regulation of innate immune response • protein K48-linked deubiquitination • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • regulation of inflammatory response • protein deubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process • протеоліз • protein deubiquitination • protein K11-linked deubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	161725	170711
Ensembl	ENSG00000169918	ENSMUSG00000033510
UniProt	Q8TE49	Q8R554
RefSeq (мРНК)	NM_130901 NM_001329907 NM_001382637	NM_130880
RefSeq (білок)	NP_001316836 NP_570971 NP_001369566	NP_570950
Локус (UCSC)	Хр. 15: 31.48 – 31.87 Mb	Хр. 7: 63.09 – 63.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVSSVLPNPT		SAECWAALLH		DPMTLDMDAV		LSDFVRSTGA		EPGLARDLLE
GKNWDLTAAL		SDYEQLRQVH		TANLPHVFNE		GRGPKQPERE		PQPGHKVERP
CLQRQDDIAQ		EKRLSRGISH		ASSAIVSLAR		SHVASECNNE		QFPLEMPIYT
FQLPDLSVYS		EDFRSFIERD		LIEQATMVAL		EQAGRLNWWS		TVCTSCKRLL
PLATTGDGNC		LLHAASLGMW		GFHDRDLVLR		KALYTMMRTG		AEREALKRRW
RWQQTQQNKE		EEWEREWTEL		LKLASSEPRT		HFSKNGGTGG		GVDNSEDPVY
ESLEEFHVFV		LAHILRRPIV		VVADTMLRDS		GGEAFAPIPF		GGIYLPLEVP
PNRCHCSPLV		LAYDQAHFSA		LVSMEQRDQQ		REQAVIPLTD		SEHKLLPLHF
AVDPGKDWEW		GKDDNDNARL		AHLILSLEAK		LNLLHSYMNV		TWIRIPSETR
APLAQPESPT		ASAGEDVQSL		ADSLDSDRDS		VCSNSNSNNG		KNGKDKEKEK
QRKEKDKTRA		DSVANKLGSF		SKTLGIKLKK		NMGGLGGLVH		GKMGRANSAN
GKNGDSAERG		KEKKAKSRKG		SKEESGASAS		TSPSEKTTPS		PTDKAAGASP
AEKGGGPRGD		AWKYSTDVKL		SLNILRAAMQ		GERKFIFAGL		LLTSHRHQFH
EEMIGYYLTS		AQERFSAEQE		QRRRDAATAA		AAAAAAAAAT		AKRPPRRPET
EGVPVPERAS		PGPPTQLVLK		LKERPSPGPA		AGRAARAAAG		GTASPGGGAR
RASASGPVPG		RSPPAPARQS		VIHVQASGAR		DEACAPAVGA		LRPCATYPQQ
NRSLSSQSYS		PARAAALRTV		NTVESLARAV		PGALPGAAGT		AGAAEHKSQT
YTNGFGALRD		GLEFADADAP		TARSNGECGR		GGPGPVQRRC		QRENCAFYGR
AETEHYCSYC		YREELRRRRE		ARGARP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bremm A., Freund S.M., Komander D. (2010). Lys11-linked ubiquitin chains adopt compact conformations and are preferentially hydrolyzed by the deubiquitinase Cezanne. Nat. Struct. Mol. Biol. 17: 939—947. PMID 20622874 DOI:10.1038/nsmb.1873

Див. також

• Хромосома 15