OTUB1

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

OTUB1 (англ. OTU deubiquitinase, ubiquitin aldehyde binding 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 271 амінокислот, а молекулярна маса — 31 284[4].

OTUB1
Наявні структури
PDBПошук для людей: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи OTUB1, OTB1, OTU1, HSPC263, OTU deubiquitinase, ubiquitin aldehyde binding 1
Зовнішні ІД OMIM: 608337 HomoloGene: 134542 GeneCards: OTUB1
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_017670
XM_039080063
RefSeq (білок)
NP_060140
н/д
Локус (UCSC) Хр. 11: 63.99 – 64 Mb н/д
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MAAEEPQQQKQEPLGSDSEGVNCLAYDEAIMAQQDRIQQEIAVQNPLVSE
RLELSVLYKEYAEDDNIYQQKIKDLHKKYSYIRKTRPDGNCFYRAFGFSH
LEALLDDSKELQRFKAVSAKSKEDLVSQGFTEFTIEDFHNTFMDLIEQVE
KQTSVADLLASFNDQSTSDYLVVYLRLLTSGYLQRESKFFEHFIEGGRTV
KEFCQQEVEPMCKESDHIHIIALAQALSVSIQVEYMDRGEGGTTNPHIFP
EGSEPKVYLLYRPGHYDILYK

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

ред.
  • Balakirev M.Y., Tcherniuk S.O., Jaquinod M., Chroboczek J. (2003). Otubains: a new family of cysteine proteases in the ubiquitin pathway. EMBO Rep. 4: 517—522. PMID 12704427 DOI:10.1038/sj.embor.embor824
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Stanisic V., Malovannaya A., Qin J., Lonard D.M., O'Malley B.W. (2009). OTU Domain-containing ubiquitin aldehyde-binding protein 1 (OTUB1) deubiquitinates estrogen receptor (ER) alpha and affects ERalpha transcriptional activity. J. Biol. Chem. 284: 16135—16145. PMID 19383985 DOI:10.1074/jbc.M109.007484
  • Wiener R., Zhang X., Wang T., Wolberger C. (2012). The mechanism of OTUB1-mediated inhibition of ubiquitination. Nature. 483: 618—622. PMID 22367539 DOI:10.1038/nature10911

Примітки

ред.
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23077 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, Q96FW1 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

ред.