ONECUT1

ONECUT1 (англ. One cut homeobox 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 51 023.

ONECUT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1S7E
Ідентифікатори
Символи	ONECUT1, HNF-6, HNF6, HNF6A, one cut homeobox 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604164 MGI: 1196423 HomoloGene: 3309 GeneCards: ONECUT1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • epithelial cell development • диференціація клітин • cell fate commitment • endoderm development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of cell migration • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • spleen development • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of cell-matrix adhesion • glucose metabolic process • pancreas development • liver development • B cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • organism system development • endocrine pancreas development • cilium assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3175	15379
Ensembl	ENSG00000169856	ENSMUSG00000043013
UniProt	Q9UBC0	O08755
RefSeq (мРНК)	NM_004498	NM_008262
RefSeq (білок)	NP_004489	NP_032288
Локус (UCSC)	Хр. 15: 52.76 – 52.79 Mb	Хр. 9: 74.77 – 74.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNAQLTMEAI		GELHGVSHEP		VPAPADLLGG		SPHARSSVAH		RGSHLPPAHP
RSMGMASLLD		GGSGGGDYHH		HHRAPEHSLA		GPLHPTMTMA		CETPPGMSMP
TTYTTLTPLQ		PLPPISTVSD		KFPHHHHHHH		HHHHPHHHQR		LAGNVSGSFT
LMRDERGLAS		MNNLYTPYHK		DVAGMGQSLS		PLSSSGLGSI		HNSQQGLPHY
AHPGAAMPTD		KMLTPNGFEA		HHPAMLGRHG		EQHLTPTSAG		MVPINGLPPH
HPHAHLNAQG		HGQLLGTARE		PNPSVTGAQV		SNGSNSGQME		EINTKEVAQR
ITTELKRYSI		PQAIFAQRVL		CRSQGTLSDL		LRNPKPWSKL		KSGRETFRRM
WKWLQEPEFQ		RMSALRLAAC		KRKEQEHGKD		RGNTPKKPRL		VFTDVQRRTL
HAIFKENKRP		SKELQITISQ		QLGLELSTVS		NFFMNARRRS		LDKWQDEGSS
NSGNSSSSSS		TCTKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 15