NUP153
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
NUP153 (англ. Nucleoporin 153) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 475 амінокислот, а молекулярна маса — 153 938[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MASGAGGVGG | GGGGKIRTRR | CHQGPIKPYQ | QGRQQHQGIL | SRVTESVKNI | ||||
VPGWLQRYFN | KNEDVCSCST | DTSEVPRWPE | NKEDHLVYAD | EESSNITDGR | ||||
ITPEPAVSNT | EEPSTTSTAS | NYPDVLTRPS | LHRSHLNFSM | LESPALHCQP | ||||
STSSAFPIGS | SGFSLVKEIK | DSTSQHDDDN | ISTTSGFSSR | ASDKDITVSK | ||||
NTSLPPLWSP | EAERSHSLSQ | HTATSSKKPA | FNLSAFGTLS | PSLGNSSILK | ||||
TSQLGDSPFY | PGKTTYGGAA | AAVRQSKLRN | TPYQAPVRRQ | MKAKQLSAQS | ||||
YGVTSSTARR | ILQSLEKMSS | PLADAKRIPS | IVSSPLNSPL | DRSGIDITDF | ||||
QAKREKVDSQ | YPPVQRLMTP | KPVSIATNRS | VYFKPSLTPS | GEFRKTNQRI | ||||
DNKCSTGYEK | NMTPGQNREQ | RESGFSYPNF | SLPAANGLSS | GVGGGGGKMR | ||||
RERTRFVASK | PLEEEEMEVP | VLPKISLPIT | SSSLPTFNFS | SPEITTSSPS | ||||
PINSSQALTN | KVQMTSPSST | GSPMFKFSSP | IVKSTEANVL | PPSSIGFTFS | ||||
VPVAKTAELS | GSSSTLEPII | SSSAHHVTTV | NSTNCKKTPP | EDCEGPFRPA | ||||
EILKEGSVLD | ILKSPGFASP | KIDSVAAQPT | ATSPVVYTRP | AISSFSSSGI | ||||
GFGESLKAGS | SWQCDTCLLQ | NKVTDNKCIA | CQAAKLSPRD | TAKQTGIETP | ||||
NKSGKTTLSA | SGTGFGDKFK | PVIGTWDCDT | CLVQNKPEAI | KCVACETPKP | ||||
GTCVKRALTL | TVVSESAETM | TASSSSCTVT | TGTLGFGDKF | KRPIGSWECS | ||||
VCCVSNNAED | NKCVSCMSEK | PGSSVPASSS | STVPVSLPSG | GSLGLEKFKK | ||||
PEGSWDCELC | LVQNKADSTK | CLACESAKPG | TKSGFKGFDT | SSSSSNSAAS | ||||
SSFKFGVSSS | SSGPSQTLTS | TGNFKFGDQG | GFKIGVSSDS | GSINPMSEGF | ||||
KFSKPIGDFK | FGVSSESKPE | EVKKDSKNDN | FKFGLSSGLS | NPVSLTPFQF | ||||
GVSNLGQEEK | KEELPKSSSA | GFSFGTGVIN | STPAPANTIV | TSENKSSFNL | ||||
GTIETKSASV | APFTCKTSEA | KKEEMPATKG | GFSFGNVEPA | SLPSASVFVL | ||||
GRTEEKQQEP | VTSTSLVFGK | KADNEEPKCQ | PVFSFGNSEQ | TKDENSSKST | ||||
FSFSMTKPSE | KESEQPAKAT | FAFGAQTSTT | ADQGAAKPVF | SFLNNSSSSS | ||||
STPATSAGGG | IFGSSTSSSN | PPVATFVFGQ | SSNPVSSSAF | GNTAESSTSQ | ||||
SLLFSQDSKL | ATTSSTGTAV | TPFVFGPGAS | SNNTTTSGFG | FGATTTSSSA | ||||
GSSFVFGTGP | SAPSASPAFG | ANQTPTFGQS | QGASQPNPPG | FGSISSSTAL | ||||
FPTGSQPAPP | TFGTVSSSSQ | PPVFGQQPSQ | SAFGSGTTPN | SSSAFQFGSS | ||||
TTNFNFTNNS | PSGVFTFGAN | SSTPAASAQP | SGSGGFPFNQ | SPAAFTVGSN | ||||
GKNVFSSSGT | SFSGRKIKTA | VRRRK |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.
Література
ред.- McMorrow I., Bastos R., Horton H., Burke B. (1994). Sequence analysis of a cDNA encoding a human nuclear pore complex protein, hnup153. Biochim. Biophys. Acta. 1217: 219—223. PMID 8110839 DOI:10.1016/0167-4781(94)90040-X
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Brownawell A.M., Macara I.G. (2002). Exportin-5, a novel karyopherin, mediates nuclear export of double-stranded RNA binding proteins. J. Cell Biol. 156: 53—64. PMID 11777942 DOI:10.1083/jcb.200110082
- Frosst P., Guan T., Subauste C., Hahn K., Gerace L. (2002). Tpr is localized within the nuclear basket of the pore complex and has a role in nuclear protein export. J. Cell Biol. 156: 617—630. PMID 11839768 DOI:10.1083/jcb.200106046
- Hase M.E., Cordes V.C. (2003). Direct interaction with nup153 mediates binding of Tpr to the periphery of the nuclear pore complex. Mol. Biol. Cell. 14: 1923—1940. PMID 12802065 DOI:10.1091/mbc.E02-09-0620
- Krull S., Thyberg J., Bjorkroth B., Rackwitz H.R., Cordes V.C. (2004). Nucleoporins as components of the nuclear pore complex core structure and Tpr as the architectural element of the nuclear basket. Mol. Biol. Cell. 15: 4261—4277. PMID 15229283 DOI:10.1091/mbc.E04-03-0165
Примітки
ред.- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з NUP153 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8062 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P49790 (англ.) . Архів оригіналу за 7 жовтня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також
ред.На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |