NR1I3

NR1I3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1XVP, 1XV9
Ідентифікатори
Символи	NR1I3, CAR, CAR1, MB67, nuclear receptor subfamily 1 group I member 3
Зовнішні ІД	OMIM: 603881 MGI: 1346307 HomoloGene: 3759 GeneCards: NR1I3
Реагує на сполуку
	5β-pregnane-3,20-dione, клотримазол, (RS)-meclizine
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001105 transcription coactivator activity; • zinc ion binding; • зв'язування з іоном металу; • steroid hormone receptor activity; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • transcription factor binding; • nuclear receptor coactivator activity; • signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • нуклеоплазма; • цитоскелет; • клітинне ядро; • RNA polymerase II transcription regulator complex;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • steroid hormone mediated signaling pathway; • androgen receptor signaling pathway; • intracellular receptor signaling pathway; • multicellular organism development; • диференціація клітин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9970
	12355
	ENSG00000143257
	ENSMUSG00000005677
	Q14994; Q6GZ81
	O35627
NM_001077469; NM_001077470; NM_001077471; NM_001077472; NM_001077473;
	NM_001077474; NM_001077475; NM_001077476; NM_001077477; NM_001077478; NM_001077479; NM_001077480; NM_001077481; NM_001077482; NM_005122
	NM_001243062; NM_001243063; NM_009803
NP_001070937; NP_001070938; NP_001070939; NP_001070940; NP_001070941;
	NP_001070942; NP_001070943; NP_001070944; NP_001070945; NP_001070946; NP_001070947; NP_001070948; NP_001070949; NP_001070950; NP_005113
	NP_001229991; NP_001229992; NP_033933
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NR1I3 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 39 942^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASREDELRN	CVVCGDQATG	YHFNALTCEG	CKGFFRRTVS	KSIGPTCPFA
GSCEVSKTQR	RHCPACRLQK	CLDAGMRKDM	ILSAEALALR	RAKQAQRRAQ
QTPVQLSKEQ	EELIRTLLGA	HTRHMGTMFE	QFVQFRPPAH	LFIHHQPLPT
LAPVLPLVTH	FADINTFMVL	QVIKFTKDLP	VFRSLPIEDQ	ISLLKGAAVE
ICHIVLNTTF	CLQTQNFLCG	PLRYTIEDGA	RVSPTVGFQV	EFLELLFHFH
GTLRKLQLQE	PEYVLLAAMA	LFSPDRPGVT	QRDEIDQLQE	EMALTLQSYI
KGQQRRPRDR	FLYAKLLGLL	AELRSINEAY	GYQIQHIQGL	SAMMPLLQEI
CS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Choi H.S., Seol W., Moore D.D. (1996). A component of the 26S proteasome binds on orphan member of the nuclear hormone receptor superfamily. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 56: 23—30. PMID 8603043 DOI:10.1016/0960-0760(95)00220-0
Kobayashi K., Sueyoshi T., Inoue K., Moore R., Negishi M. (2003). Cytoplasmic accumulation of the nuclear receptor CAR by a tetratricopeptide repeat protein in HepG2 cells. Mol. Pharmacol. 64: 1069—1075. PMID 14573755 DOI:10.1124/mol.64.5.1069