NR1H3

NR1H3 (англ. Nuclear receptor subfamily 1 group H member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 447 амінокислот, а молекулярна маса — 50 396.

NR1H3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1UHL, 3IPQ, 3IPS, 3IPU, 5AVI, 5AVL, 5HJS
Ідентифікатори
Символи	NR1H3, LXR-a, LXRA, RLD-1, Liver X receptor alpha, nuclear receptor subfamily 1 group H member 3
Зовнішні ІД	OMIM: 602423 MGI: 1352462 HomoloGene: 21165 GeneCards: NR1H3
Пов'язані генетичні захворювання
метаболічні захворювання
Реагує на сполуку
(25R)-cholest-5-ene-3β,26-diol, desmosterol
Онтологія гена Молекулярна функція • cholesterol binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • sterol response element binding • steroid hormone receptor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity Клітинна компонента • receptor complex • Нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • positive regulation of toll-like receptor 4 signaling pathway • sterol homeostasis • negative regulation of pancreatic juice secretion • negative regulation of inflammatory response • cellular response to lipopolysaccharide • negative regulation of lipid transport • positive regulation of lipoprotein lipase activity • lipid homeostasis • triglyceride homeostasis • negative regulation of macrophage activation • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation • positive regulation of cholesterol transport • negative regulation of cholesterol storage • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of triglyceride biosynthetic process • positive regulation of cholesterol efflux • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process • negative regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • regulation of circadian rhythm • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • response to progesterone • steroid hormone mediated signaling pathway • apoptotic cell clearance • positive regulation of fatty acid biosynthetic process • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of secretion of lysosomal enzymes • negative regulation of pinocytosis • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • intracellular receptor signaling pathway • cholesterol homeostasis • lipid metabolism • multicellular organism development • диференціація клітин • negative regulation of cold-induced thermogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10062	22259
Ensembl	ENSG00000025434	ENSMUSG00000002108
UniProt	Q13133	Q9Z0Y9
RefSeq (мРНК)	NM_001130101 NM_001130102 NM_001251934 NM_001251935 NM_005693	NM_001177730 NM_013839 NM_001355279
RefSeq (білок)	NP_001123573 NP_001123574 NP_001238863 NP_001238864 NP_005684 NP_001350524 NP_005684.2	NP_001171201 NP_038867 NP_001342208
Локус (UCSC)	Хр. 11: 47.25 – 47.27 Mb	Хр. 2: 91.01 – 91.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLWLGAPVP		DIPPDSAVEL		WKPGAQDASS		QAQGGSSCIL		REEARMPHSA
GGTAGVGLEA		AEPTALLTRA		EPPSEPTEIR		PQKRKKGPAP		KMLGNELCSV
CGDKASGFHY		NVLSCEGCKG		FFRRSVIKGA		HYICHSGGHC		PMDTYMRRKC
QECRLRKCRQ		AGMREECVLS		EEQIRLKKLK		RQEEEQAHAT		SLPPRASSPP
QILPQLSPEQ		LGMIEKLVAA		QQQCNRRSFS		DRLRVTPWPM		APDPHSREAR
QQRFAHFTEL		AIVSVQEIVD		FAKQLPGFLQ		LSREDQIALL		KTSAIEVMLL
ETSRRYNPGS		ESITFLKDFS		YNREDFAKAG		LQVEFINPIF		EFSRAMNELQ
LNDAEFALLI		AISIFSADRP		NVQDQLQVER		LQHTYVEALH		AYVSIHHPHD
RLMFPRMLMK		LVSLRTLSSV		HSEQVFALRL		QDKKLPPLLS		EIWDVHE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11