NEIL2

NEIL2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1VZP
Ідентифікатори
Символи	NEIL2, NEH2, NEI2, nei like DNA glycosylase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608933 MGI: 2686058 HomoloGene: 17032 GeneCards: NEIL2
Пов'язані генетичні захворювання
	alcohol dependence
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • microtubule binding; • zinc ion binding; • hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds; • зв'язування з іоном металу; • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds; • damaged DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • каталітична активність; • lyase activity; • nucleic acid binding; • DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity; • hydrolase activity; • DNA N-glycosylase activity; • class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • microtubule cytoskeleton; • spindle microtubule; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• nucleotide-excision repair; • cellular response to DNA damage stimulus; • depyrimidination; • обмін речовин; • base-excision repair; • GO:0100026 Репарація ДНК;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	252969
	382913
	ENSG00000154328
	ENSMUSG00000035121
	Q969S2
	Q6R2P8
	NM_001135746; NM_001135747; NM_001135748; NM_145043
	NM_201610
NP_001129218; NP_001129219; NP_001129220; NP_659480; NP_001336368;
	NP_001336369; NP_001336370; NP_001336371
	NP_963904
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NEIL2 (англ. Nei like DNA glycosylase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 332 амінокислот, а молекулярна маса — 36 826^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPEGPLVRKF	HHLVSPFVGQ	QVVKTGGSSK	KLQPASLQSL	WLQDTQVHGK
KLFLRFDLDE	EMGPPGSSPT	PEPPQKEVQK	EGAADPKQVG	EPSGQKTLDG
SSRSAELVPQ	GEDDSEYLER	DAPAGDAGRW	LRVSFGLFGS	VWVNDFSRAK
KANKRGDWRD	PSPRLVLHFG	GGGFLAFYNC	QLSWSSSPVV	TPTCDILSEK
FHRGQALEAL	GQAQPVCYTL	LDQRYFSGLG	NIIKNEALYR	AGIHPLSLGS
VLSASRREVL	VDHVVEFSTA	WLQGKFQGRP	QHTQVYQKEQ	CPAGHQVMKE
AFGPEDGLQR	LTWWCPQCQP	QLSEEPEQCQ	FS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, гідролаз, глікозидаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Dou H., Mitra S., Hazra T.K. (2003). Repair of oxidized bases in DNA bubble structures by human DNA glycosylases NEIL1 and NEIL2. J. Biol. Chem. 278: 49679—49684. PMID 14522990 DOI:10.1074/jbc.M308658200
Bhakat K.K., Hazra T.K., Mitra S. (2004). Acetylation of the human DNA glycosylase NEIL2 and inhibition of its activity. Nucleic Acids Res. 32: 3033—3039. PMID 15175427 DOI:10.1093/nar/gkh632