MSC

MSC (англ. Musculin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 206 амінокислот, а молекулярна маса — 22 068.

MSC
Ідентифікатори
Символи	MSC, ABF-1, ABF1, MYOR, bHLHa22, musculin
Зовнішні ІД	OMIM: 603628 MGI: 1333884 HomoloGene: 3738 GeneCards: MSC
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • protein dimerization activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • roof of mouth development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • branchiomeric skeletal muscle development • transcription, DNA-templated • diaphragm development • cellular response to leukemia inhibitory factor Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9242	17681
Ensembl	ENSG00000178860	ENSMUSG00000025930
UniProt	O60682	O88940
RefSeq (мРНК)	NM_005098	NM_010827 NM_001360810
RefSeq (білок)	NP_005089	NP_034957 NP_001347739
Локус (UCSC)	Хр. 8: 71.84 – 71.84 Mb	Хр. 1: 14.82 – 14.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSTGSVSDPE		EMELRGLQRE		YPVPASKRPP		LRGVERSYAS		PSDNSSAEEE
DPDGEEERCA		LGTAGSAEGC		KRKRPRVAGG		GGAGGSAGGG		GKKPLPAKGS
AAECKQSQRN		AANARERARM		RVLSKAFSRL		KTSLPWVPPD		TKLSKLDTLR
LASSYIAHLR		QLLQEDRYEN		GYVHPVNLTW		PFVVSGRPDS		DTKEVSAANR
LCGTTA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Robb L., Hartley L., Wang C.-C., Harvey R.P., Begley C.G. (1998). Musculin: a murine basic helix-loop-helix transcription factor gene expressed in embryonic skeletal muscle. Mech. Dev. 76: 197—201. PMID 9767165 DOI:10.1016/S0925-4773(98)00122-1

Див. також

• Хромосома 8