LHX5

LHX5 (англ. LIM homeobox 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 402 амінокислот, а молекулярна маса — 44 406.

LHX5
Ідентифікатори
Символи	LHX5, LIM homeobox 5
Зовнішні ІД	OMIM: 605992 MGI: 107792 HomoloGene: 40621 GeneCards: LHX5
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • cerebellar Purkinje cell-granule cell precursor cell signaling involved in regulation of granule cell precursor cell proliferation • cerebellar Purkinje cell differentiation • cell-cell signaling • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cell proliferation in forebrain • hippocampus development • regulation of cell population proliferation • spinal cord association neuron differentiation • transcription, DNA-templated • cerebellum development • forebrain neuron differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • neuron differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64211	16873
Ensembl	ENSG00000089116	ENSMUSG00000029595
UniProt	Q9H2C1	P61375
RefSeq (мРНК)	NM_022363	NM_008499
RefSeq (білок)	NP_071758	NP_032525
Локус (UCSC)	Хр. 12: 113.46 – 113.47 Mb	Хр. 5: 120.57 – 120.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMVHCAGCER		PILDRFLLNV		LDRAWHIKCV		QCCECKTNLS		EKCFSREGKL
YCKNDFFRRF		GTKCAGCAQG		ISPSDLVRKA		RSKVFHLNCF		TCMVCNKQLS
TGEELYVIDE		NKFVCKDDYL		SSSSLKEGSL		NSVSSCTDRS		LSPDLQDALQ
DDPKETDNST		SSDKETANNE		NEEQNSGTKR		RGPRTTIKAK		QLETLKAAFA
ATPKPTRHIR		EQLAQETGLN		MRVIQVWFQN		RRSKERRMKQ		LSALGARRHA
FFRSPRRMRP		LGGRLDESEM		LGSTPYTYYG		DYQGDYYAPG		SNYDFFAHGP
PSQAQSPADS		SFLAASGPGS		TPLGALEPPL		AGPHAADNPR		FTDMISHPDT
PSPEPGLPGT		LHPMPGEVFS		GGPSPPFPMS		GTSGYSGPLS		HPNPELNEAA
VW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Zhao Y., Hermesz E., Yarolin M.C., Westphal H. (2000). Genomic structure, chromosomal localization and expression of the human LIM-homeobox gene LHX5. Gene. 260: 95—101. PMID 11137295 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00466-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12