LGMN

LGMN
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4N6N, 4N6O, 4FGU, 4AWB, 4AWA, 4AW9
Ідентифікатори
Символи	LGMN, AEP, LGMN1, PRSC1, legumain
Зовнішні ІД	OMIM: 602620 MGI: 1330838 HomoloGene: 38075 GeneCards: LGMN
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity; • GO:0070122 peptidase activity; • hydrolase activity; • cysteine-type endopeptidase activity; • tau protein binding;
Клітинна компонента	• late endosome; • apical part of cell; • lysosomal lumen; • лізосома; • екзосома; • endolysosome lumen; • extracellular region; • цитоплазма; • perinuclear region of cytoplasm;
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • negative regulation of ERBB signaling pathway; • renal system process; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; • vitamin D metabolic process; • negative regulation of multicellular organism growth; • vacuolar protein processing; • receptor catabolic process; • протеоліз; • toll-like receptor signaling pathway; • proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • response to acidic pH; • пам'ять; • positive regulation of cell population proliferation; • associative learning; • negative regulation of gene expression; • cellular response to hepatocyte growth factor stimulus; • positive regulation of mitotic cell cycle; • cellular response to calcium ion; • positive regulation of monocyte chemotaxis; • dendritic spine organization; • activation of cysteine-type endopeptidase activity; • self proteolysis; • positive regulation of long-term synaptic potentiation; • cellular response to amyloid-beta; • positive regulation of endothelial cell chemotaxis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5641
	19141
	ENSG00000100600
	ENSMUSG00000021190
	Q99538
	O89017
	NM_001008530; NM_005606; NM_001363696; NM_001363699
	NM_011175; NM_001378875
	NP_001008530; NP_005597; NP_001350625; NP_001350628
	NP_035305; NP_001365804
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LGMN (англ. Legumain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 433 амінокислот, а молекулярна маса — 49 411^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVWKVAVFLS	VALGIGAVPI	DDPEDGGKHW	VVIVAGSNGW	YNYRHQADAC
HAYQIIHRNG	IPDEQIVVMM	YDDIAYSEDN	PTPGIVINRP	NGTDVYQGVP
KDYTGEDVTP	QNFLAVLRGD	AEAVKGIGSG	KVLKSGPQDH	VFIYFTDHGS
TGILVFPNED	LHVKDLNETI	HYMYKHKMYR	KMVFYIEACE	SGSMMNHLPD
NINVYATTAA	NPRESSYACY	YDEKRSTYLG	DWYSVNWMED	SDVEDLTKET
LHKQYHLVKS	HTNTSHVMQY	GNKTISTMKV	MQFQGMKRKA	SSPVPLPPVT
HLDLTPSPDV	PLTIMKRKLM	NTNDLEESRQ	LTEEIQRHLD	ARHLIEKSVR
KIVSLLAASE	AEVEQLLSER	APLTGHSCYP	EALLHFRTHC	FNWHSPTYEY
ALRHLYVLVN	LCEKPYPLHR	IKLSMDHVCL	GHY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у лізосомі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chen J.-M., Fortunato M., Barrett A.J. (2000). Activation of human prolegumain by cleavage at a C-terminal asparagine residue. Biochem. J. 352: 327—334. PMID 11085925 DOI:10.1042/bj3520327
Halfon S., Patel S., Vega F., Zurawski S., Zurawski G. (1998). Autocatalytic activation of human legumain at aspartic acid residues. FEBS Lett. 438: 114—118. PMID 9821970 DOI:10.1016/S0014-5793(98)01281-2
Dall E., Brandstetter H. (2013). Mechanistic and structural studies on legumain explain its zymogenicity, distinct activation pathways, and regulation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110: 10940—10945. PMID 23776206 DOI:10.1073/pnas.1300686110
Tanaka T., Inazawa J., Nakamura Y. (1996). Molecular cloning of a human cDNA encoding putative cysteine protease (PRSC1) and its chromosome assignment to 14q32.1. Cytogenet. Cell Genet. 74: 120—123. PMID 8893817

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9472 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q99538 (англ.) . Архів оригіналу за 28 лютого 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 14

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9472 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q99538 (англ.) . Архів оригіналу за 28 лютого 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]