HOXA6

HOXA6 (англ. Homeobox A6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 233 амінокислот, а молекулярна маса — 26 339.

HOXA6
Ідентифікатори
Символи	HOXA6, HOX1, HOX1.2, HOX1B, homeobox A6
Зовнішні ІД	OMIM: 142951 MGI: 96178 HomoloGene: 7765 GeneCards: HOXA6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • embryonic skeletal system morphogenesis • multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • embryonic skeletal system development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3203	15403
Ensembl	ENSG00000106006	ENSMUSG00000043219
UniProt	P31267	P09092
RefSeq (мРНК)	NM_024014	NM_010454
RefSeq (білок)	NP_076919	NP_034584
Локус (UCSC)	Хр. 7: 27.15 – 27.15 Mb	Хр. 6: 52.18 – 52.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSYFVNPTF		PGSLPSGQDS		FLGQLPLYQA		GYDALRPFPA		SYGASSLPDK
TYTSPCFYQQ		SNSVLACNRA		SYEYGASCFY		SDKDLSGASP		SGSGKQRGPG
DYLHFSPEQQ		YKPDSSSGQG		KALHDEGADR		KYTSPVYPWM		QRMNSCAGAV
YGSHGRRGRQ		TYTRYQTLEL		EKEFHFNRYL		TRRRRIEIAN		ALCLTERQIK
IWFQNRRMKW		KKENKLINST		QPSGEDSEAK		AGE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7