HMCES

HMCES (англ. 5-hydroxymethylcytosine (hmC) binding, ES cell-specific) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 354 амінокислот, а молекулярна маса — 40 575.

HMCES
Ідентифікатори
Символи	HMCES, C3orf37, SRAPD1, DC12, 5-hydroxymethylcytosine (hmC) binding, ES cell-specific, 5-hydroxymethylcytosine binding, ES cell specific
Зовнішні ІД	OMIM: 618288 MGI: 1914053 HomoloGene: 6636 GeneCards: HMCES
шифр КФ	3.4.-.-
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56941	232210
Ensembl	ENSG00000183624	ENSMUSG00000030060
UniProt	Q96FZ2	Q8R1M0
RefSeq (мРНК)	NM_001006109 NM_020187 NM_001363881 NM_001370343 NM_001370344 NM_001370345	NM_173737
RefSeq (білок)	NP_001006109 NP_064572 NP_001350810 NP_001357272 NP_001357273 NP_001357274	NP_776098
Локус (UCSC)	Хр. 3: 129.28 – 129.31 Mb	Хр. 6: 87.89 – 87.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MCGRTSCHLP		RDVLTRACAY		QDRRGQQRLP		EWRDPDKYCP		SYNKSPQSNS
PVLLSRLHFE		KDADSSERII		APMRWGLVPS		WFKESDPSKL		QFNTTNCRSD
TVMEKRSFKV		PLGKGRRCVV		LADGFYEWQR		CQGTNQRQPY		FIYFPQIKTE
KSGSIGAADS		PENWEKVWDN		WRLLTMAGIF		DCWEPPEGGD		VLYSYTIITV
DSCKGLSDIH		HRMPAILDGE		EAVSKWLDFG		EVSTQEALKL		IHPTENITFH
AVSSVVNNSR		NNTPECLAPV		DLVVKKELRA		SGSSQRMLQW		LATKSPKKED
SKTPQKEESD		VPQWSSQFLQ		KSPLPTKRGT		AGLLEQWLKR		EKEEEPVAKR
PYSQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з ДНК.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Aravind L., Anand S., Iyer L.M. (2013). Novel autoproteolytic and DNA-damage sensing components in the bacterial SOS response and oxidized methylcytosine-induced eukaryotic DNA demethylation systems. Biol. Direct. 8: 20—20. PMID 23945014 DOI:10.1186/1745-6150-8-20

Див. також

• Хромосома 3